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zhangxingc

铁杆木虫 (著名写手)

[求助] 微生物 种 亚种的分子生物学鉴定

RT
现在发现一个种有好几个亚种
请教大虾,如何利用分子生物学手段将乳酸菌菌种鉴定到亚种的水平
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凡夫俗子

至尊木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2013-10-15 15:57:02
zhangxingc: 金币+3, 有帮助, 生理生化的结果不确定性太大 2013-10-16 09:14:00
目前没有鉴定到亚种的方法,只能参考《伯杰氏细菌学手册》做生理生化实验。
2楼2013-10-15 15:15:10
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chang坤

金虫 (正式写手)


kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2013-10-30 15:37:43
做下16SRNA的序列吧,再做拿到Gene bank上作对比
为了理想拼了!
3楼2013-10-16 21:13:18
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zhangxingc

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by chang坤 at 2013-10-16 21:13:18
做下16SRNA的序列吧,再做拿到Gene bank上作对比

对比了,看不出是哪个亚种
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4楼2013-10-17 16:18:55
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zting1027

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
zhangxingc: 金币+3, ★★★很有帮助, 谢谢 2013-11-12 09:04:36
its?issr?试试吧
5楼2013-10-21 16:55:27
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zhangxingc

铁杆木虫 (著名写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by zting1027 at 2013-10-21 16:55:27
its?issr?试试吧

这是两个什么呀,确实不懂
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6楼2013-10-30 11:30:42
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lvshilu

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2013-10-30 15:37:49
请先查有没有在分子生物学水平上鉴定乳酸菌亚种的引物?
就是说遗传序列能不能将亚种区分?
需要金币
7楼2013-10-30 14:17:02
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710002191

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖


myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香,分子生物期待你更多精彩。 2013-12-30 11:04:12
不是很懂微生物,我们做的是寄生虫的鉴定,你可以在NCBI上看看一般P的是他的哪段比较保守的基因,是ITS还是小亚基核糖体RNA(SSU),还有一些是用HSP70的,根据不同的物种选择不同的标签,要是一个标签比不出来的话可以同时P两个标签,通过两个标签的共同比较来确定是哪种,
may
8楼2013-10-30 15:51:27
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zting1027

金虫 (正式写手)

引用回帖:
6楼: Originally posted by zhangxingc at 2013-10-30 11:30:42
这是两个什么呀,确实不懂...

ISSR(Inter-simple sequence repeats,简单重复序列中间区域)标记技术。its估计你用不到,你试试issr吧。还有RAPD分子标记技术,上中国知网下一些相关文献看看,有很多分子标记技术,你看看你适合用哪个以及他们是如何操作的。
9楼2013-10-31 15:06:23
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