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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 存档旧帖 » 微生物 种 亚种的分子生物学鉴定
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zhangxingc

铁杆木虫 (著名写手)

[求助] 微生物 种 亚种的分子生物学鉴定

RT
现在发现一个种有好几个亚种
请教大虾，如何利用分子生物学手段将乳酸菌菌种鉴定到亚种的水平
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IwanttoaccompanyyoumorethanyouknowbutIcann't
1楼 2013-10-15 14:43:22
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凡夫俗子

至尊木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2013-10-15 15:57:02
zhangxingc: 金币+3, ★有帮助, 生理生化的结果不确定性太大 2013-10-16 09:14:00
目前没有鉴定到亚种的方法，只能参考《伯杰氏细菌学手册》做生理生化实验。
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2楼2013-10-15 15:15:10
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chang坤

金虫 (正式写手)
★
kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2013-10-30 15:37:43
做下16SRNA的序列吧，再做拿到Gene bank上作对比
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为了理想拼了！
3楼2013-10-16 21:13:18
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zhangxingc

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by chang坤 at 2013-10-16 21:13:18
做下16SRNA的序列吧，再做拿到Gene bank上作对比

对比了，看不出是哪个亚种
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IwanttoaccompanyyoumorethanyouknowbutIcann't
4楼2013-10-17 16:18:55
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zting1027

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★
zhangxingc: 金币+3, ★★★很有帮助, 谢谢 2013-11-12 09:04:36
its?issr?试试吧
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5楼2013-10-21 16:55:27
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zhangxingc

铁杆木虫 (著名写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by zting1027 at 2013-10-21 16:55:27
its?issr?试试吧

这是两个什么呀，确实不懂
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IwanttoaccompanyyoumorethanyouknowbutIcann't
6楼2013-10-30 11:30:42
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lvshilu

新虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
kx444555: 金币+1, 鼓励交流 2013-10-30 15:37:49
请先查有没有在分子生物学水平上鉴定乳酸菌亚种的引物？
就是说遗传序列能不能将亚种区分？
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需要金币
7楼2013-10-30 14:17:02
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710002191

银虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香，分子生物期待你更多精彩。 2013-12-30 11:04:12
不是很懂微生物，我们做的是寄生虫的鉴定，你可以在NCBI上看看一般P的是他的哪段比较保守的基因，是ITS还是小亚基核糖体RNA(SSU),还有一些是用HSP70的，根据不同的物种选择不同的标签，要是一个标签比不出来的话可以同时P两个标签，通过两个标签的共同比较来确定是哪种，
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may
8楼2013-10-30 15:51:27
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zting1027

金虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by zhangxingc at 2013-10-30 11:30:42
这是两个什么呀，确实不懂...

ISSR（Inter-simple sequence repeats，简单重复序列中间区域）标记技术。its估计你用不到，你试试issr吧。还有RAPD分子标记技术，上中国知网下一些相关文献看看，有很多分子标记技术，你看看你适合用哪个以及他们是如何操作的。
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9楼2013-10-31 15:06:23
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