应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » BLAST的使用方法
北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
51/1返回列表
查看: 2143  |  回复: 4
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

luna跃儿弯弯

新虫 (小有名气)

[求助] BLAST的使用方法

请问利用BLAST如何进行序列比对？跪求各位高手指点一下具体的方法~不胜感激！急急急
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

基因工程和分子生物学

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2013-10-10 22:32:31
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

xl_dut

木虫 (正式写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by luna跃儿弯弯 at 2013-10-11 18:39:48
我现在已知A基因的序列，它的下游可能是B基因也可能是C基因，（B基因和C基因通过NCBI已经确定了 都可能存在于A的下游），我是否可以通过BLAST来对A基因进行同源性比对从而确定A的下游到底是B基因还是C基因呢？刚刚 ...

NCBI数据库中的数据或序列都是已知的，包括部分单基因全序列、编码序列（cds）以及一些基因组或染色体的全序列。因此你说的B基因或C基因在A基因的下游，这种情况在特定的染色体上或基因组中是确定的，当然不同物种的基因序列和排列次序可能略有差异。
单纯通过单个基因的序列比对是不能确定先后顺序的。如果你要通过比对来确定A基因后的序列到底是B还是C的话，你必须获得基因A及其下游的序列，然后再进行比对。blast会给出部分序列的比对结果，然后你就可以确定次序了。或者你也可以设计引物进行PCR验证！
赞一下 回复此楼
一日之计在于昨天！
5楼2013-10-11 20:58:02
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答

xl_dut

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
kx444555: 金币+6, 鼓励交流 2013-10-11 16:50:53
luna跃儿弯弯: 金币+5, ★★★★★最佳答案, 谢谢~ 2013-10-11 18:34:54
进入以下网址：http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi
普通的blast在basic blast区域进行选择就行，如核苷酸-核苷酸序列比对直接选择nucleotide blast，其他的选项还有氨基酸-氨基酸序列比对（protein blast）、翻译核苷酸序列-蛋白序列比对（blastx）等，你可以根据自己的需要进行选择。
单击后进入新的界面，在enter query sequence的对话框中输入你要比对的序列或序列的NCBI登陆号或genebank的登录号，如果是下载下来的.fasta格式的文件也可以在upload file处点击浏览，然后在电脑中找到相应的文件存储位置，选择“打开”就行。
下面有一些比对的参数设置，除有特殊要求外可以不做改动。但对于数据库的选择可能会影响比对结果的数目。此外“Algorithm parameters ”下拉菜单也可以打开并可以进行一些比对参数的设置，也可以视 需要进行更改。
所有参数设置好后，点击“BLAST”按钮即可，稍等一会，网页上就会出现比对结果。楼主可以根据需要进行选择。如果楼主想对若干个已知的序列进行比对，也可以将序列下载下来，用单机版的比对软件进行比对。
赞一下(1人) 回复此楼
一日之计在于昨天！
2楼2013-10-11 15:52:59
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

luna跃儿弯弯

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by xl_dut at 2013-10-11 15:52:59
进入以下网址：http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi
普通的blast在basic blast区域进行选择就行，如核苷酸-核苷酸序列比对直接选择nucleotide blast，其他的选项还有氨基酸-氨基酸序列比对（protein blast）、 ...

我现在已知A基因的序列，它的下游可能是B基因也可能是C基因，（B基因和C基因通过NCBI已经确定了 都可能存在于A的下游），我是否可以通过BLAST来对A基因进行同源性比对从而确定A的下游到底是B基因还是C基因呢？刚刚入门，多谢指导~（刚刚的金币，送给您了吗？我还不太会送。麻烦说一下~谢谢啦~）
赞一下 回复此楼
3楼2013-10-11 18:39:48
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

luna跃儿弯弯

新虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by xl_dut at 2013-10-11 15:52:59
进入以下网址：http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi
普通的blast在basic blast区域进行选择就行，如核苷酸-核苷酸序列比对直接选择nucleotide blast，其他的选项还有氨基酸-氨基酸序列比对（protein blast）、 ...

我现在已知A基因的序列，它的下游可能是B基因也可能是C基因，（B基因和C基因通过NCBI已经确定了 都可能存在于A的下游），我是否可以通过BLAST来对A基因进行同源性比对从而确定A的下游到底是B基因还是C基因呢？刚刚入门，多谢指导~（刚刚的金币，送给您了吗？我还不太会送。麻烦说一下~谢谢啦~）
赞一下 回复此楼
4楼2013-10-11 18:45:13
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 5 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 复试调剂 +9 春日来信- 2026-04-03 9/450 2026-04-07 15:17 by 尽舜尧1
[考研] 085602化学工程268分蹲调剂 +12 月照花林。 2026-04-01 12/600 2026-04-07 15:10 by -迷了路啊路
[考研] 一志愿华东理工085601材料工程303分求调剂 +8 a1708 2026-04-06 8/400 2026-04-07 11:20 by 诗与自由
[考研] 材料调剂 +13 一样YWY 2026-04-05 14/700 2026-04-07 09:51 by piklet
[考研] 一志愿211，化学学硕，310分，本科重点双非，求调剂 +6 努力奋斗112 2026-04-06 6/300 2026-04-07 09:50 by dongzh2009
[考研] 312求调剂 +4 LR6 2026-04-06 4/200 2026-04-07 08:42 by jp9609
[考研] 考研调剂 +7 15615482637 2026-04-04 7/350 2026-04-06 22:56 by chenzhimin
[考研] 材料工程调剂 +3 小刘同学吖吖 2026-04-06 4/200 2026-04-06 20:56 by lbsjt
[考研] 材料专硕283求调剂 +17 试试看呗 2026-04-04 18/900 2026-04-06 09:24 by 286640313
[考研] 372分，材料与化工，一志愿湖南大学，求调剂 +3 蓝笺片 2026-04-01 3/150 2026-04-06 09:04 by 无际的草原
[考研] 309求调剂 +6 刘刘刘1231 2026-04-02 7/350 2026-04-04 13:41 by liucky
[考研] 调剂0855-288 +5 x熊二a 2026-04-03 5/250 2026-04-04 00:19 by 猪会飞
[考研] 兽医调剂 +3 wh119216 2026-04-02 3/150 2026-04-03 19:34 by zrongyan
[考研] 372分材料与化工（085600）一志愿湖南大学求调剂 +3 蓝笺片 2026-04-03 4/200 2026-04-03 17:58 by Jimmyandyou
[考研] 一志愿复旦材料，英一专硕，总分357调剂 +4 1050389037 2026-04-02 5/250 2026-04-02 21:40 by dongzh2009
[考研] 314求调剂 +11 1xiaojun23 2026-03-31 12/600 2026-04-02 12:31 by 1xiaojun23
[考研] 08开头看过来！！！ +4 wwwwffffff 2026-03-31 6/300 2026-04-02 11:42 by 均值回归
[考研] 材料调剂 +12 一样YWY 2026-04-01 12/600 2026-04-02 09:15 by olim
[考研] 考研调剂 +12 Amber00 2026-03-31 12/600 2026-04-02 09:04 by sanrepian
[考研] 一志愿346上海大学生物学 +3 上海大学346调剂 2026-04-01 3/150 2026-04-02 08:36 by w虫虫123
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭