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聪明的傻帽儿

木虫 (小有名气)

[交流] 启动子顺式调控元件图谱构建 已有3人参与

怎么构建顺式调控元件图谱?是要一个一个把调控元件找出来进行标记吗?用什么方法找?
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ck8148

金虫 (初入文坛)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
6楼: Originally posted by 聪明的傻帽儿 at 2013-10-17 19:05:32
这个我知道,但是预测结果看不懂,能不能指导下?...

预测的结果为上面是序列,下面是motifs found,点开继续名左边的加号就可以看到有很多子项目,分别对应序列上面标示的颜色,判断基序所在的位置,子菜单中的最后一栏为基序的说明标示与什么相关,中间的score标示算法的值,值越大说明该基序存在的可能性越大。
说的有点乱,不知道能明白不
7楼2013-10-18 09:56:32
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baby1987

金虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
先把启动子扩增出来,在一段段的deletion,然后检测荧光活性。
加油。
2楼2013-10-05 09:56:16
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聪明的傻帽儿

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by baby1987 at 2013-10-05 09:56:16
先把启动子扩增出来,在一段段的deletion,然后检测荧光活性。

我已经扩出来了,是要一段段的缺失,但是怎么缺失呢?就是随便的分段吗?应该是先把所有的调控因子还有转录因子结合位点找出来,然后根据他们的位置分段的吧?你有做过吗?我克隆出启动子后大半年了,不知从何下手
3楼2013-10-05 10:37:02
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baby1987

金虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by 聪明的傻帽儿 at 2013-10-05 10:37:02
我已经扩出来了,是要一段段的缺失,但是怎么缺失呢?就是随便的分段吗?应该是先把所有的调控因子还有转录因子结合位点找出来,然后根据他们的位置分段的吧?你有做过吗?我克隆出启动子后大半年了,不知从何下手...

设计引物啊,以已经扩出来的为模板,扩增短片段,检测荧光活性,这个网上现在好多啊。
加油。
4楼2013-10-05 11:32:20
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