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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 分子生物 » 综合其他 » 启动子顺式调控元件图谱构建
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聪明的傻帽儿

木虫 (小有名气)

[交流] 启动子顺式调控元件图谱构建已有3人参与

怎么构建顺式调控元件图谱？是要一个一个把调控元件找出来进行标记吗？用什么方法找？
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1楼2013-10-03 19:50:16
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ck8148

金虫 (初入文坛)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
6楼: Originally posted by 聪明的傻帽儿 at 2013-10-17 19:05:32
这个我知道，但是预测结果看不懂，能不能指导下？...

预测的结果为上面是序列，下面是motifs found，点开继续名左边的加号就可以看到有很多子项目，分别对应序列上面标示的颜色，判断基序所在的位置，子菜单中的最后一栏为基序的说明标示与什么相关，中间的score标示算法的值，值越大说明该基序存在的可能性越大。
说的有点乱，不知道能明白不
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7楼2013-10-18 09:56:32
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baby1987

金虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
先把启动子扩增出来，在一段段的deletion，然后检测荧光活性。
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加油。
2楼2013-10-05 09:56:16
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聪明的傻帽儿

木虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by baby1987 at 2013-10-05 09:56:16
先把启动子扩增出来，在一段段的deletion，然后检测荧光活性。

我已经扩出来了，是要一段段的缺失，但是怎么缺失呢？就是随便的分段吗？应该是先把所有的调控因子还有转录因子结合位点找出来，然后根据他们的位置分段的吧？你有做过吗？我克隆出启动子后大半年了，不知从何下手
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3楼2013-10-05 10:37:02
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baby1987

金虫 (小有名气)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by 聪明的傻帽儿 at 2013-10-05 10:37:02
我已经扩出来了，是要一段段的缺失，但是怎么缺失呢？就是随便的分段吗？应该是先把所有的调控因子还有转录因子结合位点找出来，然后根据他们的位置分段的吧？你有做过吗？我克隆出启动子后大半年了，不知从何下手...

设计引物啊，以已经扩出来的为模板，扩增短片段，检测荧光活性，这个网上现在好多啊。
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加油。
4楼2013-10-05 11:32:20
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