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实验准备中

金虫 (小有名气)

[求助] 求助:极性大的大分子物质的分离

分离出来了一个大分子物质,极性很大,点了硅胶板,点停留在原点基本不动,凝胶柱也试过了,分子量太大基本不停留,结果杂质依然很多。我该用什么办法分离呢?求助
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
kx444555: 金币+5, 鼓励交流 2013-09-24 11:53:26
silicare: MolEPI+1 2014-05-23 08:03:43
既然生物大分子的极性大,那么可以考虑用强离子交换交换层析柱试试看。
可在摸索方法的过程中用较宽的pH值范围。对于一个已知等电点的蛋白质,可根据其等电点来选择离子交换柱上的离子交换剂(离子交换剂基团不是洗脱缓冲液,是交换柱柱上的带电荷的基团,比如:羧甲基、季氨基、二乙基氨乙基等)。如果选用的离子交换柱上的离子交换剂是阴离子交换剂,使用缓冲溶液的pH值应高于该蛋白质的等电点,因为此时的蛋白质在缓冲溶液中携带净负电荷,可与离子交换柱上的阴离子交换剂结合。如果选择如果选用的离子交换柱上的离子交换剂是阳离子交换剂,使用缓冲溶液的pH值应高于该蛋白质的等电点,因为此时的蛋白质在缓冲溶液中携带净正电荷,可与离子交换柱上的阳离子交换剂结合。
对于未知的等电点的蛋白质,可以用DNAstar中的Protein,打开和新建一个序列文件。选择Analysis ---->Tritration Curve,会出来滴定曲线,横坐标为电荷数,纵坐标为pH值,在滴定曲线上找到电荷数为零的pH值即为等电点。也可以到蛋白质数据库中搜索出该蛋白质的的等电点。
未知的等电点的蛋白质,如果不是先用用软件预测其等电点,也不到到蛋白质数据库中搜索出该蛋白质的的等电点,或者说就是个未知蛋白质,而且也不愿意做等电聚焦。在这种情况下,对于未知的等电点的蛋白质,也可以直接上离子交换柱,但是操作有一定困难。此时选择离子交换柱上的离子交换剂(离子交换剂基团不是洗脱缓冲液,是交换柱柱上的带电荷的基团,比如:羧甲基、季氨基、二乙基氨乙基等)比较费事。在实际操作中常选择这样的方法:先选择一个阴离子交换剂(离子交换剂基团不是洗脱缓冲液,是交换柱柱上的带电荷的基团,比如:羧甲基、季氨基、二乙基氨乙基等),再寻则一个中性的pH缓冲溶液(pH大约为7),将蛋白质pH为7的环境下透析去掉小分子杂质,然后过阴离子交换柱,根据过柱后的结果确定下一个使用的缓冲溶液的pH值。如果目的蛋白质在穿过液中,也就是没有结合到交换柱上直接流出了,那木说明目的蛋白质在该pH下带有正电荷,可将缓冲溶液的pH升高1,然后在将蛋白质pH为8的环境下透析去掉小分子杂质,然后再过阴离子交换柱,根据过柱后的结果确定下一个使用的缓冲溶液的pH值。以此类推,直到目的蛋白质能够结合到阴离子交换柱为止。也可以使用阳离子交换柱做类似的选择。
2楼2013-09-24 11:27:28
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普通回帖

凌波丽

专家顾问 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★
kx444555: 金币+2, 鼓励交流 2013-09-24 11:53:32
生物大分子的分子量大,用凝胶过滤分离是可以用sepharose 4B凝胶过滤介质,其分离范围是60-20000KD,再怎么样也够了吧,不至于生物大分子的分子量比20000KD还大吧,如果真的那木大就用超速离心分离了。
3楼2013-09-24 11:32:04
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凌波丽

专家顾问 (知名作家)

离子交换剂不是洗脱缓冲液,是交换柱的柱上的带电荷的固有基团,比如:羧甲基、季氨基、二乙基氨乙基等。
4楼2013-09-24 12:06:32
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zhenwuhuang

至尊木虫 (文学泰斗)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
5楼2013-09-24 12:53:30
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