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52散步的鱼

铜虫 (初入文坛)

[交流] 用MS如何得到(ZnO)12的直角坐标 已有1人参与

我想要借助MS提取12个ZnO的指教坐标,可每次优化得到的都只有一个晶包几何数据,怎样才能把12个ZnO的几何坐标一次性拿出来呢?求高手指点
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Voland

金虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
……用Gaussian吧,文件导入后存成GJF格式就能看到了……
Yağma!Yağma!Yağma!
2楼2013-09-10 23:08:05
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Voland

金虫 (小有名气)

噢噢……用MS好像也行,在Property那里有显示
Yağma!Yağma!Yağma!
3楼2013-09-10 23:09:40
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52散步的鱼

铜虫 (初入文坛)

我本身就是研究Gaussian的,用Gaussview画这种大分子,太有难度了,我是想从MS的库里面调出ZnO的直角坐标,再转到Gaussview里看,不知道有没有办法
4楼2013-09-11 16:50:40
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52散步的鱼

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by Voland at 2013-09-10 23:08:05
……用Gaussian吧,文件导入后存成GJF格式就能看到了……

试了,没试明白,能说的详尽一点吗?
5楼2013-09-11 16:51:54
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Voland

金虫 (小有名气)

★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
identation: 金币+1, 谢谢应助和回帖交流! 2013-09-12 07:44:27
引用回帖:
5楼: Originally posted by 52散步的鱼 at 2013-09-11 16:51:54
试了,没试明白,能说的详尽一点吗?...

= =那简单,File-Export然后存成.mol格式,在GaussView里面打开就行了,打开再存成.gjf格式,搞定。
Yağma!Yağma!Yağma!
6楼2013-09-11 22:43:30
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Voland

金虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
顺带一提,这种方法得到的.gjf文件可能会出现将一个原子的模型建成两个空间坐标完全相同的原子,直接计算会显示距离太近的错误,建议提交之前检查一下。
Yağma!Yağma!Yağma!
7楼2013-09-11 22:45:37
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