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kazenokizi新虫 (初入文坛)
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[交流]
拉伸大分子使其伸直无应变 已有2人参与
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大家好，我使用gromacs模拟了单个大分子，现在需要将其伸直。我的方法是，用make_ndx将一端设定为reference组，另一端设定为move组；然后用genrestr得到porse.itp，并把相关内容加入分子的itp文件，把pull code加入mdp文件。之后用genbox加水，最小化能量，进行拖拽，出现fatal error，提示topol.tpr不能找到。请问是哪个部分出了问题？谢谢大家。 [ Last edited by kazenokizi on 2013-9-9 at 16:43 ] |
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1、建议你先看看gromacs 的模拟流程（GROMACS_MD_Flowchart.pdf），也许你就自然知道问题所在 地址：http://ishare.iask.sina.com.cn/f/15271185.html 2、好好参考一个官网的这个教程吧： http://www.bevanlab.biochem.vt.e ... umbrella/index.html |
2楼2013-09-10 10:37:16
kazenokizi
新虫 (初入文坛)
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- 性别: GG
- 专业: 生物大分子结构与功能
3楼2013-09-20 10:26:26
4楼2017-05-03 15:40:49
