24小时热门版块排行榜    

查看: 2637  |  回复: 10
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

lengxue_lc

新虫 (小有名气)

[求助] THz光谱计算求助

请问下,做吸收光谱时候(比如简单的vitaminC),method怎么设置的啊?如何得到吸收谱图,还有opt和Freg用的基组必须一样嘛?opt时需要用到TDDFT不?如下图,如何得到理论的absorbtion谱呢
THz光谱计算求助
11.jpg

[ Last edited by zhou2009 on 2013-8-30 at 09:28 ]
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

经验

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lengxue_lc

新虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by hairan at 2013-08-30 11:03:31
输入文件中%chk那一行等号后面只留下文件名就行,路径全部去掉
Windows下的文件转入linux下需要用dos2unix命令处理一下文件。...

文件转入的问题我解决了,在算opt freq时,用gview直接生成的gif文件默认把opt freq放在b3lyp/6-31g(d)的前面,我把它们的顺序颠倒回来,同时,路径删除了,就可以算了~主要是我把log文件,在result里打开vibrations里面横坐标虽然可以设置THz但是纵坐标改变不了,仍然只能是epsilon~我想要吸收谱,怎么设置啊~如上图~
8楼2013-08-30 15:39:18
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 11 个回答

hairan

木虫 (著名写手)

瞌睡木虫

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gkf高: 金币+8 2013-08-29 22:33:25
lengxue_lc: 金币+20, ★★★★★最佳答案, 万分感激 2013-08-30 09:13:18
看你给出的图,你是要模拟THz光谱;
THz光谱是基态振动光谱,因此你只需要计算opt freq就行了,不需要用到算电子激发态的TDDFT;
关于opt和freq用的基组是否需要相同,回答是必须相同。如果你用GaussView做设置,在Job Type中直接选择opt+freq就好,后面的Method中选择你要选择的方法和基组。

计算之后出来的输出文件,用GaussView打开,在Results菜单中选择Vibrations,然后在出来的窗口中选择Spectrum,在出来的图谱上用单击鼠标右键会出现一个菜单,选择Properties,又出来一个设置窗口,在X-axis项目的unit处的下拉菜单选择THz就能得到你想要的THz光谱。

如果横坐标范围太大,你可以用鼠标左键在谱图中画一个合适的方框,就能得到范围大致合适的光谱。

模拟THz光谱需要设想所有可能的结构(包括可能的分子组成和每种组成下所有结构异构体及构象异构体等),然后找出能量最低的一个或者几个,通过综合考虑来模拟才能与实验谱取得较好吻合。另外DFT方法需要选择就有长程相互作用的,基组需要用到较完备的基组,比如最低要求是6-311++G(d,p)。

你给出来的这个例子中的理论模拟谱与实验谱的差别就太大了。可以说模拟的很失败!

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

据权威报纸调查,84%的青少年犯罪者有玩电子游戏的经历,故应该禁止经营电子游戏。据我们所知,100%的青少年犯罪者有穿鞋的经历,故制鞋厂应该停业。
2楼2013-08-29 22:18:37
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

hairan

木虫 (著名写手)

瞌睡木虫

【答案】应助回帖

★ ★ ★
gkf高: 金币+3 2013-08-29 22:33:36
补充一下
找出能量最低的一个或者几个异构体是指同一个组分下的。不同组分下的能量不具有可比性,不同组分的能量最低的异构体中哪一个更合理需要通过与实验谱的比较才能知道那个组分是最可能的实际存在组分。
据权威报纸调查,84%的青少年犯罪者有玩电子游戏的经历,故应该禁止经营电子游戏。据我们所知,100%的青少年犯罪者有穿鞋的经历,故制鞋厂应该停业。
3楼2013-08-29 22:27:30
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lengxue_lc

新虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by hairan at 2013-08-29 22:18:37
看你给出的图,你是要模拟THz光谱;
THz光谱是基态振动光谱,因此你只需要计算opt freq就行了,不需要用到算电子激发态的TDDFT;
关于opt和freq用的基组是否需要相同,回答是必须相同。如果你用GaussView做设置, ...

真心的感谢~我是第一次接触到gaussian,之前找了好多,都不得要领,赶紧按照你的方法试一试~嘿嘿
4楼2013-08-30 09:15:32
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[基金申请] 面上模板改不了页边距吧? +5 ieewxg 2026-02-25 6/300 2026-03-01 00:10 by addressing
[考研] 304求调剂 +3 52hz~~ 2026-02-28 5/250 2026-03-01 00:00 by 52hz~~
[考研] 317一志愿华南理工电气工程求调剂 +5 Soliloquy_Q 2026-02-28 8/400 2026-02-28 23:36 by xyx2012xyx
[考研] 292求调剂 +3 yhk_819 2026-02-28 3/150 2026-02-28 21:57 by gaoxiaoniuma
[考博] 26申博 +4 想申博! 2026-02-26 4/200 2026-02-28 21:37 by limorning
[考研] 材料学调剂 +5 提神豆沙包 2026-02-28 5/250 2026-02-28 21:34 by gaoxiaoniuma
[考研] 311求调剂 +8 南迦720 2026-02-28 8/400 2026-02-28 21:30 by gaoxiaoniuma
[考研] 高分子化学与物理调剂 +4 好好好1233 2026-02-28 7/350 2026-02-28 20:42 by 好好好1233
[考研] 085600材料工程一志愿中科大总分312求调剂 +8 吃宵夜1 2026-02-28 10/500 2026-02-28 20:27 by L135790
[考研] 276求调剂 +3 路lyh123 2026-02-28 4/200 2026-02-28 19:45 by 路lyh123
[考研] 0856材料求调剂 +10 hyf hyf hyf 2026-02-28 11/550 2026-02-28 18:50 by 无际的草原
[考博] 博士自荐 +3 kkluvs 2026-02-28 3/150 2026-02-28 16:59 by StarAura
[高分子] 求环氧树脂研发1名 +3 孙xc 2026-02-25 11/550 2026-02-28 16:57 by ichall
[考研] 265分求调剂不调专业和学校有行学上就 +4 礼堂丁真258 2026-02-28 6/300 2026-02-28 16:18 by 求调剂zz
[考研] 304求调剂 +5 曼殊2266 2026-02-28 6/300 2026-02-28 12:44 by 迷糊CCPs
[硕博家园] 博士自荐 +6 科研狗111 2026-02-26 9/450 2026-02-28 12:32 by seaskyy
[考研] 272求调剂 +3 田智友 2026-02-28 3/150 2026-02-28 12:31 by 王加浩to
[考研] 298求调剂 +4 axyz3 2026-02-28 4/200 2026-02-28 11:21 by wang_dand
[基金申请] 面上可以超过30页吧? +12 阿拉贡aragon 2026-02-22 13/650 2026-02-26 22:09 by Hahaxia
[硕博家园] 【博士招生】太原理工大学2026化工博士 +4 N1ce_try 2026-02-24 8/400 2026-02-26 08:40 by N1ce_try
信息提示
请填处理意见