应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 分子模拟 » MS » 实现annealing退火过程
51/1返回列表
查看: 3684  |  回复: 9
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看
当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖

敏sunflower

金虫 (小有名气)

[求助] 实现annealing退火过程

各位大侠能否指点一二。
最近做annealing退火过程时，看到文献上有这样的描述：温度范围为300-500K,温度间隔为20K，在每个间隔中进行NPT动力学100ps，在达到每个温度点（如：320K、340K）时又要进行5ns的NPT动力学。
但是我用forcite实现annealing过程时，系综只有NVE和NVT，并没有NPT；还有怎样设置在达到温度点之后进行5nsNPT呐？
附件中是从文章中接下来的annealing过程[ 来自小组 寂寞大虫家族 ]
回复此楼

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : annealing.doc
    • 2013-08-20 17:55:23, 76 K

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

淘贴

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
1楼 2013-08-20 17:55:52
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪
★
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2013-08-22 10:38:59
dynamic task一般用上次的anneal task的最后一个结构作为初始结构
赞一下 回复此楼

» 本帖已获得的红花（最新10朵）

敏sunflower
#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
3楼2013-08-20 19:29:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答

pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
chaizhm: 金币+5, 谢谢~ 2013-08-22 10:38:47
1、anneal可以找到NPT系综
我不知道你的是什么结构文件，我这里是周期性结构
实现annealing退火过程


2、按你给的那段话的意思是这么做的：

360——340，100psNPT的anneal task
340：5nsNPT的dynamic task
340——320：同上 一次类推
赞一下 回复此楼
#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
2楼2013-08-20 19:25:55
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

敏sunflower

金虫 (小有名气)
送红花一朵
引用回帖:
3楼: Originally posted by pigrass at 2013-08-20 19:29:07
dynamic task一般用上次的anneal task的最后一个结构作为初始结构

谢谢pigrass的回复，但是我感觉你说的这个annealing过程好像不对，以300-320k为例，进行annealing过程：温度变化是300-320-300k,也就是说最后温度仍然是300，这样就无法依次进行到500k了吧？！
赞一下 回复此楼
4楼2013-08-21 09:48:50
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pigrass

专家顾问 (著名写手)

伊卡斯特的小猪

【答案】应助回帖

引用回帖:
4楼: Originally posted by 敏sunflower at 2013-08-21 09:48:50
谢谢pigrass的回复，但是我感觉你说的这个annealing过程好像不对，以300-320k为例，进行annealing过程：温度变化是300-320-300k,也就是说最后温度仍然是300，这样就无法依次进行到500k了吧？！...

不好意思
很久没碰退火，也没怎么仔细研究过
刚试了下，可以设置后一次完成整个过程

实现annealing退火过程-1
这是一张anneal的温度图，温度间隔是20K，每个平台的NPT是0.8ps

实现annealing退火过程-2
三个设置
heating ramp per cycle =(500-300)/20K间隔
恒温平台时间=dynamic step per ramp*time step，按你的说明，平台时间是要100ps。至于这两个变量怎么设置最好找找文献


在每个间隔中进行NPT动力学100ps
这个我暂时还没找到，我在想是不是提取那几个温度的结构，分别作dynamic task。因为MD和anneal是不同的task
赞一下 回复此楼
#有问题发论坛，不接受私聊#爱晶体，爱MaterialsStudio#MS专辑点击右边#http://emuch.net/taotie/41673.html#物性数据#http://webbook.nist.gov/chemistry/#
5楼2013-08-21 13:19:58
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 10 个回答
普通表情 龙 兔 虎 猫
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[硕博家园] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +5 YHiw1gou1Eda 2026-11-10 8/400 2026-11-14 22:20 by Equinoxhua
[公派出国] 售SCI一区文章，我:8O5.5.1.O5.4,科目全,可伽急 +3 TZqyNTBa07NP 2026-11-13 3/150 2026-11-14 16:09 by KXypaGgBBlw7
[考博] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 TZqyNTBa07NP 2026-11-13 3/150 2026-11-14 15:58 by KXypaGgBBlw7
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 SX5mJmPWDfOO 2026-11-13 3/150 2026-11-14 13:46 by KXypaGgBBlw7
[论文投稿] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 XJXMuRjD7cK7 2026-11-13 3/150 2026-11-14 13:02 by KXypaGgBBlw7
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +4 gRND4NVAZ8VG 2026-11-11 5/250 2026-11-13 11:15 by Equinoxhua
[考研] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +8 zSbvVX9JFl9J 2026-11-09 9/450 2026-11-13 11:11 by Equinoxhua
[考博] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +4 TgvkbZZl9tqB 2026-11-11 6/300 2026-11-12 12:42 by ECLTXnJnRSXf
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +5 czAiolzR0IJC 2026-11-10 7/350 2026-11-12 11:09 by HajghKOMynmz
[考研] 售SCI一区T0P文章，我:8O.55.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +5 czAiolzR0IJC 2026-11-10 6/300 2026-11-12 11:03 by HajghKOMynmz
[教师之家] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 czAiolzR0IJC 2026-11-10 7/350 2026-11-12 11:00 by HajghKOMynmz
[基金申请] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +4 czAiolzR0IJC 2026-11-10 8/400 2026-11-12 11:00 by HajghKOMynmz
[硕博家园] 售SCI文章，我:8O.5.5.1O.54,科目全,可十急 +4 G2rhSvqvhNzl 2026-11-10 6/300 2026-11-12 10:49 by HajghKOMynmz
[教师之家] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O54,科目全,可伽急 +7 FChKX8meu1ds 2026-11-09 12/600 2026-11-12 09:43 by HajghKOMynmz
[硕博家园] 售SCI-T0P文章，我:8O.5.5.1.O.54,科目齐全,可+急 +8 cqv1zKnzd7hr 2026-11-09 12/600 2026-11-12 09:32 by HajghKOMynmz
[基金申请] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可+急 +6 zSbvVX9JFl9J 2026-11-09 9/450 2026-11-12 09:21 by HajghKOMynmz
[教师之家] 售SCI一区文章，我:8.O.551.O.5.4,科目全,可伽急 +3 TgvkbZZl9tqB 2026-11-11 3/150 2026-11-12 08:26 by HajghKOMynmz
[考研] 售SCI一区文章，我:8.O.55.1.O.54,科目齐全,可伽急 +3 cdqGD6ftHmbl 2026-11-11 3/150 2026-11-12 07:53 by HajghKOMynmz
[公派出国] 售SCI一区T0P文章，我:8.O.55.1.O.5.4,科目全,可+急 +3 gRND4NVAZ8VG 2026-11-11 3/150 2026-11-12 07:42 by HajghKOMynmz
[考研] 售一区SCI文章T0P，我:8O.551.O54,科目全,可十急 +3 Z7qfCsdIiD1T 2026-11-10 4/200 2026-11-12 02:23 by 9fOTqj074tIg
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭