| 查看: 3029 | 回复: 9 | ||||
敏sunflower金虫 (小有名气)
|
[求助]
实现annealing退火过程
|
|
各位大侠能否指点一二。 最近做annealing退火过程时，看到文献上有这样的描述：温度范围为300-500K,温度间隔为20K，在每个间隔中进行NPT动力学100ps，在达到每个温度点（如：320K、340K）时又要进行5ns的NPT动力学。 但是我用forcite实现annealing过程时，系综只有NVE和NVT，并没有NPT；还有怎样设置在达到温度点之后进行5nsNPT呐？ 附件中是从文章中接下来的annealing过程[ 来自小组 寂寞大虫家族 ] |
回复此楼» 本帖附件资源列表
-
欢迎监督和反馈：小木虫仅提供交流平台，不对该内容负责。
本内容由用户自主发布，如果其内容涉及到知识产权问题，其责任在于用户本人，如对版权有异议，请联系邮箱：xiaomuchong@tal.com - 附件 1 : annealing.doc
2013-08-20 17:55:23, 76 K
» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 淘贴 |
» 猜你喜欢
毕业后当辅导员了，天天各种学生超烦
已经有5人回复
-
职称评审没过，求安慰
已经有50人回复
-
26申博自荐
已经有3人回复
-
A期刊撤稿
已经有4人回复
-
垃圾破二本职称评审标准
已经有17人回复
-
投稿Elsevier的Neoplasia杂志，到最后选publishing options时页面空白，不能完成投稿
已经有22人回复
-
EST投稿状态问题
已经有7人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 如何充分形成发卡结构
已经有9人回复
- 冷变形后再结晶退火的性能？
已经有14人回复
- 变形速率动态再结晶
已经有10人回复
- 【交流】做晶体考博首选的学校或研究所的课题组简介--重奖
已经有38人回复
- 【求助】MS如何实现水分子与SiO2反应的分子动力学模拟过程（想得到Si-OH键）？
已经有21人回复
- 【分享】关于Boltzmann 的计算代码（MATLAB）
已经有9人回复
- 【讨论】热处理对织构的影响
已经有16人回复
pigrass
专家顾问 (著名写手)
伊卡斯特的小猪
-
专家经验: +503 - 模拟EPI: 4
- 应助: 377 (硕士)
- 金币: 10371
- 散金: 3286
- 红花: 166
- 帖子: 2101
- 在线: 1968.4小时
- 虫号: 1463681
- 注册: 2011-10-27
- 性别: GG
- 专业: 高分子材料结构与性能
- 管辖: 分子模拟
2楼2013-08-20 19:25:55
pigrass
专家顾问 (著名写手)
伊卡斯特的小猪
-
专家经验: +503 - 模拟EPI: 4
- 应助: 377 (硕士)
- 金币: 10371
- 散金: 3286
- 红花: 166
- 帖子: 2101
- 在线: 1968.4小时
- 虫号: 1463681
- 注册: 2011-10-27
- 性别: GG
- 专业: 高分子材料结构与性能
- 管辖: 分子模拟
★
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2013-08-22 10:38:59
chaizhm: 金币+1, 谢谢~ 2013-08-22 10:38:59
| dynamic task一般用上次的anneal task的最后一个结构作为初始结构 |
» 本帖已获得的红花（最新10朵）
敏sunflower3楼2013-08-20 19:29:07
敏sunflower
金虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1144.8
- 散金: 17
- 红花: 2
- 帖子: 179
- 在线: 116.2小时
- 虫号: 2088951
- 注册: 2012-10-27
- 性别: MM
- 专业: 化学反应工程
4楼2013-08-21 09:48:50
pigrass
专家顾问 (著名写手)
伊卡斯特的小猪
-
专家经验: +503 - 模拟EPI: 4
- 应助: 377 (硕士)
- 金币: 10371
- 散金: 3286
- 红花: 166
- 帖子: 2101
- 在线: 1968.4小时
- 虫号: 1463681
- 注册: 2011-10-27
- 性别: GG
- 专业: 高分子材料结构与性能
- 管辖: 分子模拟
【答案】应助回帖
|
不好意思 很久没碰退火，也没怎么仔细研究过 刚试了下，可以设置后一次完成整个过程  这是一张anneal的温度图，温度间隔是20K，每个平台的NPT是0.8ps  三个设置 heating ramp per cycle =(500-300)/20K间隔 恒温平台时间=dynamic step per ramp*time step，按你的说明，平台时间是要100ps。至于这两个变量怎么设置最好找找文献 在每个间隔中进行NPT动力学100ps 这个我暂时还没找到，我在想是不是提取那几个温度的结构，分别作dynamic task。因为MD和anneal是不同的task |
5楼2013-08-21 13:19:58
pigrass
专家顾问 (著名写手)
伊卡斯特的小猪
-
专家经验: +503 - 模拟EPI: 4
- 应助: 377 (硕士)
- 金币: 10371
- 散金: 3286
- 红花: 166
- 帖子: 2101
- 在线: 1968.4小时
- 虫号: 1463681
- 注册: 2011-10-27
- 性别: GG
- 专业: 高分子材料结构与性能
- 管辖: 分子模拟
6楼2013-08-21 13:21:43
pigrass
专家顾问 (著名写手)
伊卡斯特的小猪
-
专家经验: +503 - 模拟EPI: 4
- 应助: 377 (硕士)
- 金币: 10371
- 散金: 3286
- 红花: 166
- 帖子: 2101
- 在线: 1968.4小时
- 虫号: 1463681
- 注册: 2011-10-27
- 性别: GG
- 专业: 高分子材料结构与性能
- 管辖: 分子模拟
★ ★
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2013-08-22 10:39:25
chaizhm: 金币+2, 谢谢~ 2013-08-22 10:39:25
|
没查到你的那篇原文献 不过我找到一篇相近的 可能有些出入，不过相对好理解点 Molecular simulation study of polyurethane membranes Mahmoud Rahmati, Hamid Modarress*, Reza Gooya 这篇文献的anneal过程差不多 取anneal的最终结构跑dynamic task得到298K 0.1MPa下的稳定结构  |
» 本帖已获得的红花（最新10朵）
7楼2013-08-21 15:19:58
敏sunflower
金虫 (小有名气)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 金币: 1144.8
- 散金: 17
- 红花: 2
- 帖子: 179
- 在线: 116.2小时
- 虫号: 2088951
- 注册: 2012-10-27
- 性别: MM
- 专业: 化学反应工程
8楼2013-08-22 10:12:40
pigrass
专家顾问 (著名写手)
伊卡斯特的小猪
-
专家经验: +503 - 模拟EPI: 4
- 应助: 377 (硕士)
- 金币: 10371
- 散金: 3286
- 红花: 166
- 帖子: 2101
- 在线: 1968.4小时
- 虫号: 1463681
- 注册: 2011-10-27
- 性别: GG
- 专业: 高分子材料结构与性能
- 管辖: 分子模拟
好的~ 9楼2013-08-22 10:47:25
10楼2018-03-06 22:02:28