24小时热门版块排行榜    

北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
查看: 2148  |  回复: 7

Jianxiao_H

金虫 (正式写手)

[求助] 帮看看这个primer dimer会不会有对荧光qPCR有太大影响。

实在是找不到合适的引物对了,只有看看这个有cross dimer的引物对(二聚体配对碱基数达到了5个)行不行了。
打算利用dimer tm值与产物tm值得差,来排除二聚体对荧光的影响。
但是,我不知道这个dimer的tm值是多少,我的产物tm值有85左右。
帮看看这个primer dimer会不会有对荧光qPCR有太大影响。
SXT(62FS9`9ZIX[OY8VV[@L.jpg
回复此楼
多少辛酸不可告人。
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
二聚体还好,基本不会产生太大的影响

你的上下游GC含量相差有点大,建议进一步优化一下
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
2楼2013-08-05 20:54:57
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Jianxiao_H

金虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by gyesang at 2013-08-05 20:54:57
二聚体还好,基本不会产生太大的影响

你的上下游GC含量相差有点大,建议进一步优化一下

是的,我看了看上下游相差了百分之八,谢谢你的提醒。
但是我不知道两个引物见得gc值相差最多应该控制在百分之几的范围。
多少辛酸不可告人。
3楼2013-08-05 21:27:05
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

gyesang

荣誉版主 (著名写手)

优秀版主优秀版主

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by Jianxiao_H at 2013-08-05 21:27:05
是的,我看了看上下游相差了百分之八,谢谢你的提醒。
但是我不知道两个引物见得gc值相差最多应该控制在百分之几的范围。...

GC含量一般在40%-60%,上下游引物的GC含量最好一致
学术问题讨论咨询发邮件gyesang@163.com
4楼2013-08-05 21:36:47
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yb19841014

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
gyesang: 金币+2, 鼓励回帖应助! 2013-08-06 09:44:54
配对的位置在中间,应该还好。建议同时订两对引物。
5楼2013-08-06 06:52:25
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Jianxiao_H

金虫 (正式写手)

引用回帖:
5楼: Originally posted by yb19841014 at 2013-08-06 06:52:25
配对的位置在中间,应该还好。建议同时订两对引物。

诶,对啊。我怎么就没想到顶两对儿引物呢。。
谢谢哈!!
多少辛酸不可告人。
6楼2013-08-06 08:17:28
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

duoyidian

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
这种引物设计应该没问题,毕竟pcr出来的结果的数量是非常大的,想要的目的片段的数目很大,引物设计就是有舍有得。有事不能兼顾的,这时候就有取舍了,不过基本上没问题
7楼2013-08-06 13:52:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

Jianxiao_H

金虫 (正式写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by duoyidian at 2013-08-06 13:52:22
这种引物设计应该没问题,毕竟pcr出来的结果的数量是非常大的,想要的目的片段的数目很大,引物设计就是有舍有得。有事不能兼顾的,这时候就有取舍了,不过基本上没问题

我很赞同你的看法,我找了几天的引物了,觉得最好也只能这样了。谢谢。
多少辛酸不可告人。
8楼2013-08-06 16:10:40
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 Jianxiao_H 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 283分求调剂 +10 试试看呗 2026-04-04 10/500 2026-04-06 23:08 by chenzhimin
[考研] 080500求调剂 +10 黄宇博 2026-04-06 10/500 2026-04-06 23:02 by lbsjt
[考研] 304求调剂 +7 素年祭语 2026-04-06 9/450 2026-04-06 21:34 by wj165256
[考研] 一志愿北京2,材料与化工308求调剂 +13 熊二想上岸 2026-04-04 14/700 2026-04-06 19:42 by guanxin1001
[考研] 求调剂 +7 张.1 2026-04-05 7/350 2026-04-05 20:40 by 啵啵啵0119
[考研] 一志愿郑大0705求调剂 +3 橘十一 2026-04-02 4/200 2026-04-05 00:05 by chongya
[考研] 282电子信息0854专硕调剂 +4 202451007219 2026-04-02 6/300 2026-04-04 21:55 by laoshidan
[考研] 298求调剂 +5 zzz,,r 2026-04-02 8/400 2026-04-04 19:55 by 蓝云思雨
[考研] 292求调剂 +11 2022080213 2026-04-04 13/650 2026-04-04 18:38 by macy2011
[考研] 081200-11408-276学硕求调剂 +5 崔wj 2026-04-03 5/250 2026-04-03 15:06 by arrow8852
[考研] 数一英一285求调剂 +7 AZMK 2026-04-03 9/450 2026-04-03 13:03 by ms629
[考研] 建环,能源,土木老师路过看一看!!! +5 嘿嘿uu 2026-04-01 5/250 2026-04-03 11:47 by znian
[考研] 372分材料与化工(085600)一志愿湖南大学求调剂 +5 蓝笺片 2026-04-02 6/300 2026-04-02 21:37 by dongzh2009
[考研] 一志愿北京科技大学材料学硕328分求调剂 +6 1段时间 2026-03-31 7/350 2026-04-02 13:57 by 3041
[考研] 261求B区调剂 +5 明仔· 2026-04-01 7/350 2026-04-02 11:17 by 邹尉尉
[考研] 生物学327,求调剂 +5 书上的梅子 2026-04-01 6/300 2026-04-02 06:47 by ilovexiaobin
[考研] 279求调剂 +7 莫xiao 2026-04-01 7/350 2026-04-01 22:05 by 客尔美德
[考研] 085600,321分求调剂 +13 大馋小子 2026-03-31 13/650 2026-04-01 12:35 by chemdavid
[考研] 0855机械初试280求调剂 +3 kazenotori 2026-03-31 3/150 2026-04-01 10:08 by JourneyLucky
[考研] 一志愿西交大080500材料学硕349 +6 jqx1258 2026-03-31 7/350 2026-03-31 21:08 by yuq
信息提示
请填处理意见