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汕头大学海洋科学接受调剂
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kent1022

金虫 (著名写手)

[求助] orca并行问题 已有3人参与

在linux下成功安装了openmpi-1.4.4, make examples中的例子成功。

在 vi/etc/profile 添加环境变量
   export PATH=/usr/local/openmpi-1.4.4/bin:$PATH
   export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/usr/local/openmpi-1.4.4/lib

在~/.bashrc中添加了
export ORCA=/public/home/test/orca/orca
export PATH=$ORCA:$PATH
单核可以运行。

但是用多核时
用 # /public/home/test/orca/orca 2.inp > 2.out 命令不能计算
提示: -bash: /public/home/test/orca/orca: is a directory
请教高手问题出在哪里?

另:多节点并行该怎样配置?
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kent1022

金虫 (著名写手)

2楼2013-07-23 15:58:56
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quantum999

金虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
gmy1990: 金币+1 2013-07-23 23:19:41
看提示应该是环境变量设置的问题
3楼2013-07-23 17:08:16
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kent1022

金虫 (著名写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by quantum999 at 2013-07-23 17:08:16
看提示应该是环境变量设置的问题

我想也是,但是不知问题具体出在哪里,请明示
4楼2013-07-23 22:44:59
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bluesxn

银虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by kent1022 at 2013-07-23 22:44:59
我想也是,但是不知问题具体出在哪里,请明示...

看你设的两个export环境变量推测orca安装在/public/home/test/orca/orca目录下,那么执行是应当再加个可执行文件名比如:
/public/home/test/orca/orca/orca test.inp > test.out
5楼2014-01-30 07:42:51
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lao7

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
gmy1990: 金币+2 2014-08-24 05:40:55
kent1022: 金币+5 2014-12-09 21:41:56
kent1022: 金币+5 2014-12-09 21:42:09
把文件夹orca名字改成和执行文件(orca)不一样的名字,对应路径也要改过来就行了
6楼2014-08-23 21:45:41
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z32167

铜虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
kent1022: 金币+20 2014-12-09 21:41:50
/public/home/test/orca/orca这里应当用的是orca那个安装目录里的orca文件
首先,要清楚这个问题要知道,orca提交任务时,使用的orca指令对应的时一个在orca安装目录下的文件,orca这个安装目录下有orca,orca_2aim,orca_pltvib等等文件,其中orca这个文件是用来提交作业的。

你的这个错误提示是这样的,/public/home/test/orca/orca: is a directory,是指你的这个路径是一个目录,也就是文件夹,而并不是一个可执行文件,要解决的关键问题是你的orca安装在哪里,安装你上面问题描述的情况,估计应该将/public/home/test/orca/orca改成/public/home/test/orca/orca/orca

楼主出现的问题,是因为对linux系统不熟悉导致的
7楼2014-12-09 20:49:53
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chrinide

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

ORCA 并行的时候 要使用绝对路径 即便加到系统环境变量里也是不行的
未知必须借由更深的未知去获悉,隐晦必须借由更深的隐晦来明了
8楼2014-12-09 21:36:57
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