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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 量子化学 » Gamess/Q-Chem » 【讨论】GAMESS 的并行挺有意思的
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snoopyzhao

至尊木虫 (职业作家)

[交流] 【讨论】GAMESS 的并行挺有意思的 已有6人参与

最近还是想从头学 GAMESS，以便不依赖于 Gaussian。在一个有 2 个 4 核 CPU 上试了一下 GAMESS 的并行计算，挺方便，也挺让人郁闷的。

Gaussian 的并行计算似乎比较智能一些，在输入文件中指定 CPU 数目即可，当能计算任务可并行的时候，它就使用多个 CPU，不能并行时就使用一个 CPU。

但 GAMESS 却不是这个样子。GAMESS 运行的时候，一般是通过脚本驱动的，在这个脚本中需要给出 CPU 的个数以及各个 CPU 所在的 host id。 象我这样的，就需要把一个 host id 重复 8 次。当然，这也没有什么，反正设一次就可以了。

让人觉得郁闷的是，如果计算任务不能并行时，而偏偏又指定多个 CPU 时，就直接报错并停止运算了。

如果能稍微智能一点儿，也就是如果计算任务不能并行时，就使用一个 CPU 计算，那就好多了……
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1楼 2010-06-16 16:26:47
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shalene

至尊木虫 (著名写手)
★ ★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
heyo_123(金币+1):鼓励交流！！ 2010-06-16 19:17:11
没给钱还挑剔？

能用就很感谢作者了。
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2楼2010-06-16 18:44:37
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snoopyzhao

至尊木虫 (职业作家)
引用回帖:
Originally posted by shalene at 2010-06-16 18:44:37:
没给钱还挑剔？

能用就很感谢作者了。

我这是挑剔吗？
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3楼2010-06-16 18:52:36
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3867826

木虫 (著名写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖交流
楼主大哥 小弟有个问题想咨询下
  你的GAMESS 是自己编译的吗》？
      我去申请那GAMESS 就给我一个60多M的文件其他就没有。。。都不会弄。。。。泪奔
           我看那商业版有140多M
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拒稿，终于体会到了！乱写接受，认真写拒稿，这就是2和4的区别吗？
4楼2010-06-16 19:58:30
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snoopyzhao

至尊木虫 (职业作家)
引用回帖:
Originally posted by 3867826 at 2010-06-16 19:58:30:
楼主大哥 小弟有个问题想咨询下
  你的GAMESS 是自己编译的吗》？
      我去申请那GAMESS 就给我一个60多M的文件其他就没有。。。都不会弄。。。。泪奔
           我看那商业版有140多M

你的是什么版本啊？GAMESS-US 吗？怎么会有那么大啊，我这里下的源码也才 8M 左右啊……

我这里说的是 GAMESS-US，这个似乎没有商业版啊……
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5楼2010-06-16 20:57:46
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yoghurt117

木虫 (正式写手)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
楼主，您说的 给出cpu id重复次数什么意思，我这里的gamess可以运行，就是不能做单机多核的并行计算，想问您一下各个脚本都需要做哪些设置，谢谢！
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I am 废Man! 把握住每一刻才是最重要的！
6楼2011-05-12 18:01:52
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vividelife

银虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
1楼: Originally posted by snoopyzhao at 2010-06-16 16:26:47:
最近还是想从头学 GAMESS，以便不依赖于 Gaussian。在一个有 2 个 4 核 CPU 上试了一下 GAMESS 的并行计算，挺方便，也挺让人郁闷的。

Gaussian 的并行计算似乎比较智能一些，在输入文件中指定 CPU 数目即可， ...

你好，可以把你的脚本发个我看看吗，谢谢！
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7楼2011-10-27 23:16:13
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snoopyzhao

至尊木虫 (职业作家)
引用回帖:
7楼: Originally posted by vividelife at 2011-10-27 23:16:13:
你好，可以把你的脚本发个我看看吗，谢谢！

你去下个wingamess，里面就有相关的脚本……
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8楼2011-10-27 23:28:35
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vividelife

银虫 (小有名气)
★
小木虫(金币+0.5):给个红包，谢谢回帖
引用回帖:
8楼: Originally posted by snoopyzhao at 2011-10-27 23:28:35:
你去下个wingamess，里面就有相关的脚本……

哦，谢谢，我说的是Linux下运行gamess的pbs脚本，能指导下吗！谢谢
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9楼2011-10-27 23:36:42
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snoopyzhao

至尊木虫 (职业作家)
引用回帖:
9楼: Originally posted by vividelife at 2011-10-27 23:36:42:
哦，谢谢，我说的是Linux下运行gamess的pbs脚本，能指导下吗！谢谢

这个，不好意思，我没有用过
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10楼2011-10-27 23:37:28
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