| 查看: 2483 | 回复: 6 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
[求助]
分子生物学小白求助序列处理问题
|
|||
小弟现在是拿环境中真核浮游植物的18S 基因做生物多样性，由于没有分子生物学的背景，基本属于小白。现在拿到了一些数据，但是不懂得处理，一些生物信息学的软件也不会用，实在愁人 。望小木虫里的众大神解救 我主要的问题如下： 1、我做生物多样性，拿到序列之后的处理流程：序列处理-划分OTU-做进化树，这个想法对么？ 2、关于序列处理，我拿到一批序列后的处理思路应该是怎样？（之前没有处理过，什么都不懂，所以拿到序列之后一点想法都没有，不知道该干嘛...还望大神们提点） 3、有的序列是正向的有的是反向的，如何确定哪些序列是反向的（还有会不会有互补的序列？）？如果是反向的，那么比对的时候如何倒过来？用什么软件？怎么操作（看了半天的使用说明书还是很茫然，只有请教各位大神了）？（我现在装的软件有BioEdit，Mega 5，primer premier 5，Clustal X2，以下同） 4、序列比对的时候要把PCR的引物加进去一起比对? 添加进去的引物序列是实际引物的互补序列？比对序列的时候把不同序列中的相同的碱基序列对应起来，这样做是为了做什么？比对完之后下一步又该做什么？ 5、如何划分OTU？怎么操作？在划分OTU之前先要做好哪些准备工作？ 6、稀释曲线怎么做？ 7、检测和去除chimera是指什么？做什么用的？怎么做？ |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 脱离小白-分子生物学 |
» 猜你喜欢
湖北师范大学招调剂啦
已经有9人回复
-
邵阳学院食品与化学工程学院硕士调剂
已经有0人回复
-
化学工程及工业化学论文润色/翻译怎么收费?
已经有125人回复
-
天津商业大学 生物与医药课题组招生
已经有0人回复
-
生物化工学硕招收调剂
已经有0人回复
-
广东石油化工学院2026年硕士研究生需要多名生物，制药工程，食品专业的调剂生
已经有0人回复
-
化工申博
已经有3人回复
-
申博自荐
已经有2人回复
-
广西民族大学化学化工学院化学工程与技术学硕，材料化工专硕调剂名额充足！
已经有0人回复
» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- 霉菌18SrDNA鉴定，构建发育树的问题
已经有6人回复
- 大家帮看看我做这个系统发育树是否可用，做法是否正确，谢谢了~~
已经有16人回复
- 分子生物学的哪些手段可以给出什么样的信息（生物材料方向，分子生物学小白）
已经有14人回复
- 克隆基因全长引物设计问题
已经有32人回复
6楼2013-06-19 21:39:46
为什么都没人回啊... 2楼2013-06-16 19:22:53
4楼2013-06-17 08:45:20
wujiangjack
银虫 (初入文坛)
- 应助: 6 (幼儿园)
- 金币: 478.8
- 帖子: 47
- 在线: 128.5小时
- 虫号: 502229
- 注册: 2008-02-14
- 性别: GG
- 专业: 植物遗传学
5楼2013-06-17 13:58:12
