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godloveplum

金虫 (小有名气)

[求助] 怎样从MEGA5.0做出的系统进化图中找到各种基因的序列?

怎样从MEGA5.0做出的系统进化图中找到各种基因的序列 ?求各位大侠指点,如果有MEGA的使用经验也可以,越详细越好,不甚感激!
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Nothingisimpossibleforawillingheart!
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

【答案】应助回帖

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godloveplum: 金币+5 2013-06-13 14:57:15
不可以的,mega做出的进化图只有基因的名字。
如果你输出的是newick格式,可以用bioperl啥的读出基因的名字,然后去ncbi上获得序列

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

2楼2013-06-13 04:27:39
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godloveplum

金虫 (小有名气)

送红花一朵
引用回帖:
2楼: Originally posted by wizardfan at 2013-06-13 04:27:39
不可以的,mega做出的进化图只有基因的名字。
如果你输出的是newick格式,可以用bioperl啥的读出基因的名字,然后去ncbi上获得序列

那MEGA5.0系统分析进化作图之不是需要基因的序列吗?
Nothingisimpossibleforawillingheart!
3楼2013-06-13 15:00:02
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wizardfan

至尊木虫 (著名写手)

优秀版主

引用回帖:
3楼: Originally posted by godloveplum at 2013-06-13 15:00:02
那MEGA5.0系统分析进化作图之不是需要基因的序列吗?...

是需要,但是不需要保存的啊,这个和上菜的时候不需要同时要把原料放旁边一起上的道理是一样的
4楼2013-06-13 17:30:03
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godloveplum

金虫 (小有名气)

送红花一朵
例如MEGA5.0做出的图形中是GPRor3,不是NCBI检索的编号,我要怎么去找到它的编号,然后再去NCBI上搜索?请大侠指点,不甚感激!
Nothingisimpossibleforawillingheart!
5楼2013-06-16 16:38:47
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