| 查看: 2071 | 回复: 10 | |||
星期五13木虫 (正式写手)
|
[求助]
16sRNA系统发育树与生化试验结果不一致，该如何处理？
|
||
我在环境中筛选一株细菌，做16sRNA测序，分析是假单胞菌属，然后做了Vitek自动鉴定，结果是恶臭假单胞菌。我选择了20种假单胞菌属中的标准菌种，用mega做系统发育树，可是无论怎么做我筛选的菌种都不和恶臭假单胞菌在一起。这种情况怎么办？ 进化树.jpg |
回复此楼» 猜你喜欢
306求调剂
已经有8人回复
-
招08考数学
已经有12人回复
-
接收2026硕士调剂(学硕+专硕)
已经有4人回复
-
北科281学硕材料求调剂
已经有9人回复
-
306求0703调剂一志愿华中师范
已经有6人回复
-
276求调剂。有半年电池和半年高分子实习经历
已经有8人回复
-
材料与化工考研调剂
已经有3人回复
-
081700 调剂 267分
已经有3人回复
-
一志愿重庆大学085700资源与环境，总分308求调剂
已经有3人回复
-
336化工调剂
已经有4人回复
|
Vitek、Biolog都不行，虽然有几十个生化反应，但都不是传统的生化反应。 API是传统的生化反应，但API同样不能鉴定数据库之外的种。 像你这种情况，采用16S测序，鉴定到到属就可以了。 你这个进化树，初步表明是假单胞菌最接近斯氏假单胞菌的种，就算完成鉴定了。 如果有进一步的兴趣，请打下这个网站：http://www.bacterio.cict.fr/ 在假单胞菌属，把全部的模式序列下载了，构建进化树，或者会有100%相似的。 |
» 本帖已获得的红花（最新10朵）
星期五139楼2013-05-20 22:29:59
2楼2013-05-18 08:45:38
星期五13
木虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 贵宾: 0.25
- 金币: 3693.5
- 帖子: 793
- 在线: 80.6小时
- 虫号: 63843
- 注册: 2005-04-10
- 专业: 生物物理、生物化学与分子
3楼2013-05-18 12:54:55
4楼2013-05-18 15:29:05
星期五13
木虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 贵宾: 0.25
- 金币: 3693.5
- 帖子: 793
- 在线: 80.6小时
- 虫号: 63843
- 注册: 2005-04-10
- 专业: 生物物理、生物化学与分子
5楼2013-05-18 21:36:53
springwater
银虫 (初入文坛)
- 应助: 1 (幼儿园)
- 金币: 555.9
- 散金: 45
- 帖子: 21
- 在线: 17.8小时
- 虫号: 1253538
- 注册: 2011-04-02
- 性别: MM
- 专业: 中药质量评价
6楼2013-05-19 13:24:10
7楼2013-05-20 01:41:02
星期五13
木虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 贵宾: 0.25
- 金币: 3693.5
- 帖子: 793
- 在线: 80.6小时
- 虫号: 63843
- 注册: 2005-04-10
- 专业: 生物物理、生物化学与分子
8楼2013-05-20 14:29:48
星期五13
木虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 贵宾: 0.25
- 金币: 3693.5
- 帖子: 793
- 在线: 80.6小时
- 虫号: 63843
- 注册: 2005-04-10
- 专业: 生物物理、生物化学与分子
10楼2013-05-22 15:48:02
5