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星期五13

木虫 (正式写手)

[求助] 16sRNA系统发育树与生化试验结果不一致,该如何处理?

我在环境中筛选一株细菌,做16sRNA测序,分析是假单胞菌属,然后做了Vitek自动鉴定,结果是恶臭假单胞菌。我选择了20种假单胞菌属中的标准菌种,用mega做系统发育树,可是无论怎么做我筛选的菌种都不和恶臭假单胞菌在一起。这种情况怎么办?

进化树.jpg
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springwater

银虫 (初入文坛)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
星期五13: 金币+5, ★★★很有帮助, 谢谢!!现在不想做这么复杂。 2013-05-19 17:12:11
还可以试试rpoB基因测序,构建进化树,构建时,要选多个属的同源序列。
6楼2013-05-19 13:24:10
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查看全部 11 个回答

416114799

至尊木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

★
感谢参与,应助指数 +1
星期五13: 金币+1, 谢谢,应该不是这个原因!哈哈 2013-05-18 12:54:12
测序不准确。。现在的鉴定公司,做不出来你觉得他们会怎么做?哈哈
做人做事要低调,默默践行心中的梦想.
2楼2013-05-18 08:45:38
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星期五13

木虫 (正式写手)

测序和生化试验是分开的,测序的不知道生化结果,他们通知我说是假单胞菌,但是不能确定到种
3楼2013-05-18 12:54:55
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416114799

至尊木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
星期五13: 金币+1, 哈哈。 2013-05-18 21:39:11
星期五13: 金币+3 2013-05-19 17:12:24
引用回帖:
3楼: Originally posted by 星期五13 at 2013-05-18 12:54:55
测序和生化试验是分开的,测序的不知道生化结果,他们通知我说是假单胞菌,但是不能确定到种

那就有问题了,上海生工么?这个很差劲,经常测不出来的。。
做人做事要低调,默默践行心中的梦想.
4楼2013-05-18 15:29:05
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