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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 微生物 » 实验/技术 » 16sRNA系统发育树与生化试验结果不一致，该如何处理？
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星期五13

木虫 (正式写手)

[求助] 16sRNA系统发育树与生化试验结果不一致，该如何处理？

我在环境中筛选一株细菌，做16sRNA测序，分析是假单胞菌属，然后做了Vitek自动鉴定，结果是恶臭假单胞菌。我选择了20种假单胞菌属中的标准菌种，用mega做系统发育树，可是无论怎么做我筛选的菌种都不和恶臭假单胞菌在一起。这种情况怎么办？

进化树.jpg
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1楼 2013-05-17 17:14:20
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星期五13

木虫 (正式写手)
引用回帖:
4楼: Originally posted by 416114799 at 2013-05-18 15:29:05
那就有问题了，上海生工么？这个很差劲，经常测不出来的。。...

是吉美测的。我当时就是给了他们一个菌种让他们测16sRNA，然后我有拿到别的地方做个Vitek自动鉴定。后来测序的给我结果说是假单胞菌，但是不能确定到种。生化那里给我结果说恶臭假单胞菌。在属上是同一的。但是现在我自己做进化树，不能和恶臭在一个簇里面！
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5楼2013-05-18 21:36:53
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416114799

至尊木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
星期五13: 金币+1, 谢谢，应该不是这个原因！哈哈 2013-05-18 12:54:12
测序不准确。。现在的鉴定公司，做不出来你觉得他们会怎么做？哈哈
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做人做事要低调,默默践行心中的梦想.
2楼2013-05-18 08:45:38
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星期五13

木虫 (正式写手)
测序和生化试验是分开的，测序的不知道生化结果，他们通知我说是假单胞菌，但是不能确定到种
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3楼2013-05-18 12:54:55
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416114799

至尊木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★
星期五13: 金币+1, 哈哈。 2013-05-18 21:39:11
星期五13: 金币+3 2013-05-19 17:12:24
引用回帖:
3楼: Originally posted by 星期五13 at 2013-05-18 12:54:55
测序和生化试验是分开的，测序的不知道生化结果，他们通知我说是假单胞菌，但是不能确定到种

那就有问题了，上海生工么？这个很差劲，经常测不出来的。。
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做人做事要低调,默默践行心中的梦想.
4楼2013-05-18 15:29:05
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