| 查看: 2046 | 回复: 10 | ||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | ||
星期五13木虫 (正式写手)
|
[求助]
16sRNA系统发育树与生化试验结果不一致，该如何处理？
|
|
我在环境中筛选一株细菌，做16sRNA测序，分析是假单胞菌属，然后做了Vitek自动鉴定，结果是恶臭假单胞菌。我选择了20种假单胞菌属中的标准菌种，用mega做系统发育树，可是无论怎么做我筛选的菌种都不和恶臭假单胞菌在一起。这种情况怎么办？ 进化树.jpg |
回复此楼» 猜你喜欢
化工京区271求调剂
已经有4人回复
-
295求调剂。一志愿报考郑州大学化学工艺学硕，总分295分
已经有5人回复
-
求调剂
已经有10人回复
-
材料284求调剂，一志愿郑州大学英一数二专硕
已经有11人回复
-
0856化工专硕求调剂
已经有15人回复
-
303求调剂
已经有5人回复
-
289求调剂
已经有4人回复
-
江苏省农科院招调剂1名
已经有4人回复
-
290分材料工程085601求调剂 数二英一
已经有3人回复
-
0856调剂
已经有7人回复
|
Vitek、Biolog都不行，虽然有几十个生化反应，但都不是传统的生化反应。 API是传统的生化反应，但API同样不能鉴定数据库之外的种。 像你这种情况，采用16S测序，鉴定到到属就可以了。 你这个进化树，初步表明是假单胞菌最接近斯氏假单胞菌的种，就算完成鉴定了。 如果有进一步的兴趣，请打下这个网站：http://www.bacterio.cict.fr/ 在假单胞菌属，把全部的模式序列下载了，构建进化树，或者会有100%相似的。 |
星期五139楼2013-05-20 22:29:59
2楼2013-05-18 08:45:38
星期五13
木虫 (正式写手)
- 应助: 0 (幼儿园)
- 贵宾: 0.25
- 金币: 3693.5
- 帖子: 793
- 在线: 80.6小时
- 虫号: 63843
- 注册: 2005-04-10
- 专业: 生物物理、生物化学与分子
3楼2013-05-18 12:54:55
4楼2013-05-18 15:29:05
