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拉风蜗牛王

金虫 (正式写手)


[交流] 关于酶的Km及IC50

酶的Km会不会随酶浓度的变化而变化?我认为会,我是这样想的:Km表示酶促反应速度达到Vmax值一半时的底物浓度[S]。如果酶浓度变大,则达到1/2Vmax时的所需的底物浓度会变大,那么Km值会变大。这样的话我觉得Km就无法客观表示酶与底物的亲和力强弱了,除非说明酶浓度。
另一个问题是关于IC50值的,体系的酶浓度会不会影响IC50值?我认为会,并且认为IC50不具有客观表现抑制剂抑制强弱的能力,除非在用IC50值时说明酶浓度。
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不转录的DNA

金虫 (小有名气)


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wizardfan: 金币+2, 谢谢参与 2013-05-17 07:59:22
拉风蜗牛王: 金币+3, 谢谢!不过我不同意你的回答。 2013-05-17 20:03:54
楼主,我的解答希望能给你解惑!

1. Km:米氏常数(单位:mol/L),他表示反应速率达到最大反应速率的一半时的底物浓度。Km=(k2+k3)/k1;近似代表酶与底物的亲和力,Km越大,亲和力越小,反之相反!
2.Km只是一个酶的特征性常量!与底物浓度无关,却与环境的理化因素有关!!!这点和密度很相似!

所以你的第一个猜想我就不用多说什么了吧??!!!

3.IC50:指酶催化反应过程中,被抑制一半时抑制剂的浓度!IC50他是随着底物浓度变化而变化的!前提是你的酶浓度是一定的!这叫控制变量法!一般资料都会有介绍这个酶和抑制剂的相关信息的,如果没有,那你就得做Michaelis-Menten曲线咯!!怎么做你应该知道了吧???太长了,不多说了!具体它能不能客观的表示抑制剂能力的强弱问题,除非他在说明酶浓度和底物浓度的前提下···

好吧,就这么多吧!困了····希望能给你解惑~~~
6楼2013-05-16 23:01:39
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不转录的DNA

金虫 (小有名气)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
昨天晚上可能太困了,有些地方漏了点东西!现在补上!(对第2条的解释补上!!!)

1).Km只是一个酶的特征性常量!与底物浓度无关,却与环境的理化因素有关!当然每个酶的Km值是不同的!
对于每一个酶促反应来说,在一定条件下,他都有特定的值,因此常被用来鉴别酶。不同的酶Km值相差很大,一般为10-3~10-5 mol/L
2). 求Km值一般利用lineweaver—Burk法(双倒数作图法)来求!将V=(Vmax*[S])/(Km+[S])变形为1/V=(Km/Vmax)*(1/[S])+1/Vmax.将1/V是关于1/[S]的线性函数(希望能看懂)!令1/V=0,即可得到1/Km=-1/[S](并不表示Km是个负值!!1/Km只表示在1/[S]上的截距!!)此时,Km值已经求出!
3).说明一下,那个米氏方程公式只是他的计算公式!!!并不表示他与底物和反应速度的关系!!!!
举个例子:密度这个单位,大家都很熟悉吧!p=m/V,他是物质的固有属性,他不随物质体积和质量变化而变化的!!但是温度可以改变他!例如水的密度在4度是最大的!这个只是密度的计算公式!并不表示他与质量与体积之间的关系!

好吧 ,就这么多吧!希望对你有用!!!
10楼2013-05-17 20:11:25
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拉风蜗牛王

金虫 (正式写手)


求高手解答哈!!!!!
2楼2013-05-15 20:42:03
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gzl9901

铁杆木虫 (文坛精英)


★ ★
拉风蜗牛王: 金币+2, 谢谢! 2013-05-17 20:07:50
祝福,祝福,顶起来,抢顶楼!
3楼2013-05-15 21:01:04
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拉风蜗牛王

金虫 (正式写手)


求大神解答啊!!!!!!!!!!!!!!
4楼2013-05-16 20:22:21
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不转录的DNA

金虫 (小有名气)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
如果你改为求助帖,我相信应该有许多人会给解答!至少我会给你解答这个问题!!!
5楼2013-05-16 22:23:42
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拉风蜗牛王

金虫 (正式写手)


引用回帖:
5楼: Originally posted by 不转录的DNA at 2013-05-16 22:23:42
如果你改为求助帖,我相信应该有许多人会给解答!至少我会给你解答这个问题!!!

求助帖只能给第一个回复的人金币,要是之后的人回答的更好怎么办?
7楼2013-05-17 19:53:33
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拉风蜗牛王

金虫 (正式写手)


引用回帖:
6楼: Originally posted by 不转录的DNA at 2013-05-16 23:01:39
楼主,我的解答希望能给你解惑!

1. Km:米氏常数(单位:mol/L),他表示反应速率达到最大反应速率的一半时的底物浓度。Km=(k2+k3)/k1;近似代表酶与底物的亲和力,Km越大,亲和力越小,反之相反!
2.Km只是一 ...

对于你的回答我仍然有疑问!
我问你一个问题: 如果酶的浓度变为原来的两倍,那达到最大反应速率(此时最大反应速率应该也变为原来的两倍)的一半时的底物浓度变还是不变?
如果你认为变了那我可不可以认为Km值变了?
如果不变为什么?
8楼2013-05-17 20:01:30
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拉风蜗牛王

金虫 (正式写手)


引用回帖:
6楼: Originally posted by 不转录的DNA at 2013-05-16 23:01:39
楼主,我的解答希望能给你解惑!

1. Km:米氏常数(单位:mol/L),他表示反应速率达到最大反应速率的一半时的底物浓度。Km=(k2+k3)/k1;近似代表酶与底物的亲和力,Km越大,亲和力越小,反之相反!
2.Km只是一 ...

关于IC50值,我经常看到文献中对于1种酶比较不同抑制剂的IC50值(引用其他文献中报道的抑制剂的IC50值,并且比较时从未提及体系),来说明抑制剂抑制能力的强弱。
9楼2013-05-17 20:06:14
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不转录的DNA

金虫 (小有名气)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
8楼: Originally posted by 拉风蜗牛王 at 2013-05-17 20:01:30
对于你的回答我仍然有疑问!
我问你一个问题: 如果酶的浓度变为原来的两倍,那达到最大反应速率(此时最大反应速率应该也变为原来的两倍)的一半时的底物浓度变还是不变?
如果你认为变了那我可不可以认为Km值 ...

不好意思,他与酶的浓度无关!他是一个特征性常数!与环境的理化因素有关!就像你问我密度为什么是物质的固有属性一样,他为什么和质量和体积没关系呢?没办法,我解答可能不会令你满意!!
11楼2013-05-17 20:24:40
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不转录的DNA

金虫 (小有名气)


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拉风蜗牛王: 金币+6, 强,这个我理解了!谢谢! 2013-05-18 10:01:20
引用回帖:
8楼: Originally posted by 拉风蜗牛王 at 2013-05-17 20:01:30
对于你的回答我仍然有疑问!
我问你一个问题: 如果酶的浓度变为原来的两倍,那达到最大反应速率(此时最大反应速率应该也变为原来的两倍)的一半时的底物浓度变还是不变?
如果你认为变了那我可不可以认为Km值 ...

再给你解释下!
这个定义是在确保酶与底物充分反应的条件下进行的!!!
何为充分?就是酶全部工作,底物浓度足够!
你提高酶浓度一倍,那它的反应速率也提高一倍,你的最大反应速度也提升了一倍!!!!(你可以查查酶浓度与反应速度的关系,他们是线性的关系!前提是底物浓度足够!!!)从而V=(Vmax*[S])/(Km+[S])变形为Km=(Vmax/V-1)*[S].
你看,有变化吗?????

(将前面所有的所有的“与底物浓度无关”改为“与酶的浓度无关”,包好意思,抱歉!)
12楼2013-05-17 20:41:51
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引用回帖:
9楼: Originally posted by 拉风蜗牛王 at 2013-05-17 20:06:14
关于IC50值,我经常看到文献中对于1种酶比较不同抑制剂的IC50值(引用其他文献中报道的抑制剂的IC50值,并且比较时从未提及体系),来说明抑制剂抑制能力的强弱。...

体系的大小,有些人不愿意提及,你该懂得!但他们实验体系大小应该是一致的!要不怎么说明实验结果??我相信他们不会忘了生物实验的原则的!控制单一变量,保证其他条件不变,才能进行比较!
13楼2013-05-17 20:59:28
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拉风蜗牛王

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引用回帖:
13楼: Originally posted by 不转录的DNA at 2013-05-17 20:59:28
体系的大小,有些人不愿意提及,你该懂得!但他们实验体系大小应该是一致的!要不怎么说明实验结果??我相信他们不会忘了生物实验的原则的!控制单一变量,保证其他条件不变,才能进行比较!...

只有实验体系条件都一样时,才能比较不同抑制剂的IC50,如果不同抑制剂在抑制同一种酶时,体系条件变了,那么它们的IC50应该是不能比较的,我这样理解对吗?    实际上我觉的很多时候,作者用的体系条件不别人的体系不是完全相同的,但是他们常常拿别人抑制剂的IC50来和自己的比较。
14楼2013-05-18 10:06:02
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不转录的DNA

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拉风蜗牛王: 金币+1 2013-05-20 22:44:09
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14楼: Originally posted by 拉风蜗牛王 at 2013-05-18 10:06:02
只有实验体系条件都一样时,才能比较不同抑制剂的IC50,如果不同抑制剂在抑制同一种酶时,体系条件变了,那么它们的IC50应该是不能比较的,我这样理解对吗?    实际上我觉的很多时候,作者用的体系条件不别人的体 ...

这样理解是对的!不控制变量,你如何比较。另外其中的干扰因素太多,也没办法比较!如果你看的是中文文献,我就不发表任何言论了!你也懂得英文的,毕竟也有差别的嘛!!!那要不是每个人都能投nature和science了!!
15楼2013-05-18 11:57:33
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