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yida

木虫 (小有名气)

[求助] 分子动力学相互作用能比较

我想比较3个小分子与金属表面的相互作用能,现在用的是同一个力场,其余参数也都是相同的,但是经过500ps NVT,5ns NVE 后有两个小分子能量平衡,一个跑了2ns 多的NVE就能量过大终止了
要是能量太大的那个小分子得做其他的处理的话,其余两个是不是也得同样操作啊?模拟的话是不是也得遵循平行原则啊
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