24小时热门版块排行榜    

查看: 1365  |  回复: 5

ferris0312

木虫 (正式写手)

[求助] cif中计算的分子式C12 H12 N4 O10 Zn,实际是14个H,求大神帮忙修改下cif

cif中计算的分子式C12 H12 N4 O10 Zn,实际是14个H,求大神帮忙修改下cif。投搞审稿人说咪唑的缺氢,加上之后分子式和分子量在cif中计算出来的和实际不对了,加H后可能是H的占有量不对了,求大神帮忙看有没有办法修改。cif上传到附件,在此表示感谢。
回复此楼

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : test_0m.cif
  • 2013-05-10 00:38:30, 18.61 K

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

p452_1

至尊木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
其实你的结构是咪唑上的羧酸氧原子上缺一个质子(H),经比较键长O2-C4 = 1.292, 并且O2没有跟金属键连,所以在O2上头应该接一个H原子,但是这个H原子最好在残余峰Q峰中找到比较好。
你可以看到你的结构目前电荷不平衡,负电荷多,O2上加上H以后,正负电荷就平衡了,可能分子式也对了。
建议你在ins文件里修改分子式,在Q峰里找到O2上的H原子,命名后再做精修,应该这个问题就解决了。
老歪博
2楼2013-05-10 06:02:14
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ferris0312

木虫 (正式写手)

引用回帖:
2楼: Originally posted by p452_1 at 2013-05-10 06:02:14
其实你的结构是咪唑上的羧酸氧原子上缺一个质子(H),经比较键长O2-C4 = 1.292, 并且O2没有跟金属键连,所以在O2上头应该接一个H原子,但是这个H原子最好在残余峰Q峰中找到比较好。
你可以看到你的结构目前电荷不 ...

之前我是在氧原子上修上氢的,可是编辑还说缺H,我只好改成这样的,改后发现分子式就不对了。O2在原始数据中是用氢键与O3相连的修改掉氢键了。缺的H是N上的。
3楼2013-05-10 12:24:42
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

p452_1

至尊木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

引用回帖:
3楼: Originally posted by ferris0312 at 2013-05-10 12:24:42
之前我是在氧原子上修上氢的,可是编辑还说缺H,我只好改成这样的,改后发现分子式就不对了。O2在原始数据中是用氢键与O3相连的修改掉氢键了。缺的H是N上的。...

你现在的分子式是C12H12 N4 O10 Zn,缺了2个H原子。N2上头应该有一个H原子,你可以参考咪唑的结构式,但是O2上还应该键连一个H原子,这时候电荷才平衡,你的分子式才正确。有hkl和res(ins)文件,就可以完成这些事情。所以编辑说的有道理。
老歪博
4楼2013-05-10 14:47:22
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ferris0312

木虫 (正式写手)

引用回帖:
4楼: Originally posted by p452_1 at 2013-05-10 14:47:22
你现在的分子式是C12H12 N4 O10 Zn,缺了2个H原子。N2上头应该有一个H原子,你可以参考咪唑的结构式,但是O2上还应该键连一个H原子,这时候电荷才平衡,你的分子式才正确。有hkl和res(ins)文件,就可以完成这些事 ...

有hkl和res文件,大神能帮我修改一下吗?在此表示感谢!!!
5楼2013-05-10 23:19:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

p452_1

至尊木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
ferris0312: 金币+30, ★★★★★最佳答案, 非常感谢!!! 2013-05-11 16:24:40
引用回帖:
5楼: Originally posted by ferris0312 at 2013-05-10 23:19:46
有hkl和res文件,大神能帮我修改一下吗?在此表示感谢!!!...

可以试一试,不能保证。我的信箱是:fshi@ua.pt
老歪博
6楼2013-05-11 00:30:56
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 ferris0312 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[找工作] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全 +4 2h7du0nuhk 2026-02-07 7/350 2026-02-08 07:46 by vs90ilomwc
[公派出国] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全 +4 2h7du0nuhk 2026-02-07 8/400 2026-02-08 07:32 by vs90ilomwc
[考博] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全 +4 2h7du0nuhk 2026-02-07 8/400 2026-02-08 07:27 by vs90ilomwc
[硕博家园] 博士延得我,科研能力直往上蹿 +8 偏振片 2026-02-02 8/400 2026-02-08 06:52 by liyeqik
[考博] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全 +3 5lbyq5wrhb 2026-02-07 3/150 2026-02-08 02:52 by vs90ilomwc
[论文投稿] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全 +3 3rkserf6qr 2026-02-07 4/200 2026-02-08 02:45 by vs90ilomwc
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全 +3 3rkserf6qr 2026-02-07 3/150 2026-02-08 02:32 by vs90ilomwc
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全 +5 2h7du0nuhk 2026-02-07 5/250 2026-02-08 02:27 by vs90ilomwc
[考博] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全 +5 2h7du0nuhk 2026-02-07 5/250 2026-02-08 02:25 by vs90ilomwc
[硕博家园] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全 +4 2h7du0nuhk 2026-02-07 5/250 2026-02-08 02:12 by vs90ilomwc
[考博] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全 +4 2h7du0nuhk 2026-02-07 6/300 2026-02-08 02:07 by vs90ilomwc
[教师之家] 售SCI一区文章,我:8 O5 51O 54,科目齐全 +4 2h7du0nuhk 2026-02-07 6/300 2026-02-08 02:05 by vs90ilomwc
[教师之家] 有院领导为了换新车,用横向课题经费买了俩车 +7 瞬息宇宙 2026-02-04 7/350 2026-02-07 21:47 by tfang
[有机交流] 酰胺脱乙酰基 10+5 chibby 2026-02-03 12/600 2026-02-07 19:29 by 江东闲人
[基金申请] 同年申请2项不同项目,第1个项目里不写第2个项目的信息,可以吗 +4 hitsdu 2026-02-06 4/200 2026-02-07 13:07 by jurkat.1640
[基金申请] 有时候真觉得大城市人没有县城人甚至个体户幸福 +9 苏东坡二世 2026-02-04 10/500 2026-02-07 12:37 by 小毛球
[考博] 天津大学招2026.09的博士生,欢迎大家推荐交流(博导是本人) +4 a793625982 2026-02-05 5/250 2026-02-07 10:57 by a793625982
[公派出国] CSC & MSCA 博洛尼亚大学能源材料课题组博士/博士后招生|MSCA经费充足、排名优 +4 雨念 2026-02-01 6/300 2026-02-06 23:32 by MelissaPon
[基金申请] 面上项目申报 +3 Tide man 2026-02-01 3/150 2026-02-05 22:56 by god_tian
[教师之家] 遇见不省心的家人很难过 +18 otani 2026-02-03 22/1100 2026-02-04 11:06 by tangmnt
信息提示
请填处理意见