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yaazhaoo

禁虫 (正式写手)


[资源] 最好用的拓扑分析软件topos(含教程)

一、计算拓扑  (1) Database---Import---选文件cif.或res., 又出现打开,命一个名字1或2,再存名(如1)---打开---Yes---use code 必须为1---ok---得分子式;  (2) Program---Auto CN 点---options---matrix---只选sectors 5 save---atoms.--- OK.点auto CN  中的 Run. 只运行的不动关闭---Yes;  (3) Program ---ADS---options: schlafli 与 classification 打钩                        Coord. Seq. 选10                       Valence ---At                        (4) ---common---save centroid.   (5) Data to file ---OK----Run ---出现对话框,选Yes ---输代码 1,选金属为中心原子----右 击select----ok,出现的数据一闪即消失,去文件夹中找,ado文件用写字板打开  (6) 找 Total schlaflu symbol :{6^3}代表63拓扑

二、画图  1、双击化合物---右单击---Atoms----show Adj. Matrix  2、Compound---Auto determine----Simplify adjacent Matrix Atom EI  Remove              Type(都选) o-connected           钩 1-connected           钩 2-connected           钩 点 ok  3、program---Isocryst---铅笔画图---小树枝代表growing structure 进行相关调整 双圈代表选  如果保留选中的按黄球,删去选中的按delete
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zhaoyang6610

金虫 (正式写手)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

最近也是刚刚开始tops的学习 非常感谢您的总结
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8楼2014-11-30 11:16:07
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冬日之梦

木虫 (正式写手)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

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32楼2015-07-21 21:54:46
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铁血丹心志

木虫 (著名写手)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

Structure consists of 3D framework with U3Ba3P2O20
Structure consists of molecules (ZD1). The composition of molecule is U
Topology for ZD1
--------------------
Atom ZD1 doesn't link with bridge molecular ligands
-------------------------
Structural group analysis
-------------------------
我的导出文件怎么只有这种啊,没有shilafuli 符号,谢谢指导。
-------------------------
Structural group No 1
-------------------------
Structure consists of molecular complex groups ZD
Infinite ligands; simplification is impossible
Elapsed time: 69.78 sec.
34楼2015-07-31 17:41:26
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冬日之梦

木虫 (正式写手)


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38楼2015-09-26 11:05:21
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lukewin

金虫 (小有名气)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

不错
44楼2015-12-09 15:20:38
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佳子悠悠

新虫 (初入文坛)


45楼2015-12-20 00:11:12
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pjmzra597

新虫 (初入文坛)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

非常好
50楼2016-03-24 20:34:34
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yaazhaoo2楼
2014-11-29 10:18   回复  
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sunzan4楼
2014-11-29 15:28   回复  
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苏几岸5楼
2014-11-29 16:22   回复  
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dog4326楼
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chemphys7楼
2014-11-30 11:09   回复  
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2014-11-30 16:29   回复  
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pzq200811楼
2014-12-02 00:02   回复  
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pzq200812楼
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zhongz0613楼
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billrich14楼
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ziranzhe15楼
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wuyq650216楼
2014-12-03 05:50   回复  
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lhewen17楼
2015-01-05 19:20   回复  
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王一75518楼
2015-02-14 11:41   回复  
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lzlw81819楼
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brilliant23楼
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tcfyz24楼
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片片刘35楼
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苏几岸41楼
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三叶草547楼
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