24小时热门版块排行榜    

查看: 8977  |  回复: 122
【奖励】 本帖被评价99次,作者yaazhaoo增加金币 78

yaazhaoo

禁虫 (正式写手)


[资源] 最好用的拓扑分析软件topos(含教程)

一、计算拓扑  (1) Database---Import---选文件cif.或res., 又出现打开,命一个名字1或2,再存名(如1)---打开---Yes---use code 必须为1---ok---得分子式;  (2) Program---Auto CN 点---options---matrix---只选sectors 5 save---atoms.--- OK.点auto CN  中的 Run. 只运行的不动关闭---Yes;  (3) Program ---ADS---options: schlafli 与 classification 打钩                        Coord. Seq. 选10                       Valence ---At                        (4) ---common---save centroid.   (5) Data to file ---OK----Run ---出现对话框,选Yes ---输代码 1,选金属为中心原子----右 击select----ok,出现的数据一闪即消失,去文件夹中找,ado文件用写字板打开  (6) 找 Total schlaflu symbol :{6^3}代表63拓扑

二、画图  1、双击化合物---右单击---Atoms----show Adj. Matrix  2、Compound---Auto determine----Simplify adjacent Matrix Atom EI  Remove              Type(都选) o-connected           钩 1-connected           钩 2-connected           钩 点 ok  3、program---Isocryst---铅笔画图---小树枝代表growing structure 进行相关调整 双圈代表选  如果保留选中的按黄球,删去选中的按delete
回复此楼

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:libolin3@tal.com
  • 附件 1 : topos软件.zip
  • 2014-11-29 10:10:34, 12.81 M
  • 附件 2 : topos软件教程.zip
  • 2014-11-29 10:11:22, 22.75 M

» 收录本帖的淘贴专辑推荐

下载 精华 软件 共享
CC的晶体解析相关资料 软件

» 本帖已获得的红花(最新10朵)

» 猜你喜欢

» 本主题相关商家推荐: (我也要在这里推广)

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhaoyang6610

金虫 (正式写手)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

最近也是刚刚开始tops的学习 非常感谢您的总结
顶一下,感谢分享!
8楼2014-11-30 11:16:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

冬日之梦

木虫 (正式写手)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

顶一下,感谢分享!谢谢
32楼2015-07-21 21:54:46
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

铁血丹心志

木虫 (著名写手)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

Structure consists of 3D framework with U3Ba3P2O20
Structure consists of molecules (ZD1). The composition of molecule is U
Topology for ZD1
--------------------
Atom ZD1 doesn't link with bridge molecular ligands
-------------------------
Structural group analysis
-------------------------
我的导出文件怎么只有这种啊,没有shilafuli 符号,谢谢指导。
-------------------------
Structural group No 1
-------------------------
Structure consists of molecular complex groups ZD
Infinite ligands; simplification is impossible
Elapsed time: 69.78 sec.
34楼2015-07-31 17:41:26
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

冬日之梦

木虫 (正式写手)


顶一下,感谢分享!谢谢
38楼2015-09-26 11:05:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

lukewin

金虫 (小有名气)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

不错
44楼2015-12-09 15:20:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

佳子悠悠

新虫 (初入文坛)


45楼2015-12-20 00:11:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

pjmzra597

新虫 (初入文坛)


★★★★★ 五星级,优秀推荐

非常好
50楼2016-03-24 20:34:34
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
yaazhaoo2楼
2014-11-29 10:18   回复  
2014-11-29 14:53   回复  
五星好评  顶一下,感谢分享!
sunzan4楼
2014-11-29 15:28   回复  
五星好评  顶一下,感谢分享!
苏几岸5楼
2014-11-29 16:22   回复  
五星好评  顶一下,感谢分享!
dog4326楼
2014-11-29 17:39   回复  
三星好评  顶一下,感谢分享!
chemphys7楼
2014-11-30 11:09   回复  
五星好评  顶一下,感谢分享!
2014-11-30 13:57   回复  
五星好评  顶一下,感谢分享!
2014-11-30 16:29   回复  
五星好评  顶一下,感谢分享!
pzq200811楼
2014-12-02 00:02   回复  
五星好评  顶一下,感谢分享!
pzq200812楼
2014-12-02 00:09   回复  
顶一下,感谢分享!
zhongz0613楼
2014-12-02 09:47   回复  
五星好评  顶一下,感谢分享!
billrich14楼
2014-12-02 11:06   回复  
五星好评  
ziranzhe15楼
2014-12-02 22:58   回复  
三星好评  顶一下,感谢分享!
wuyq650216楼
2014-12-03 05:50   回复  
五星好评  顶一下 [ 发自小木虫客户端 ]
lhewen17楼
2015-01-05 19:20   回复  
五星好评  
王一75518楼
2015-02-14 11:41   回复  
五星好评  顶一下,感谢分享!
lzlw81819楼
2015-02-16 15:31   回复  
五星好评  顶一下,感谢分享!
2015-04-16 14:37   回复  
五星好评  
2015-04-16 15:23   回复  
顶一下,感谢分享!
2015-05-22 17:31   回复  
三星好评  顶一下,感谢分享!
brilliant23楼
2015-05-25 19:37   回复  
五星好评  顶一下,感谢分享!
tcfyz24楼
2015-05-27 14:47   回复  
五星好评  顶一下,感谢分享!
catalyse25楼
2015-06-16 10:50   回复  
五星好评  顶一下,感谢分享!
caipingl26楼
2015-06-17 08:37   回复  
五星好评  顶一下,感谢分享!
zax12327楼
2015-06-17 16:11   回复  
五星好评  顶一下,感谢分享!
pzq200828楼
2015-06-17 23:20   回复  
abingxueb29楼
2015-06-29 13:22   回复  
五星好评  顶一下,感谢分享!
2015-07-03 10:36   回复  
五星好评  顶一下,感谢分享!
2015-07-16 18:26   回复  
五星好评  顶一下,感谢分享!
2015-07-26 12:52   回复  
五星好评  顶一下,感谢分享!
片片刘35楼
2015-08-13 20:09   回复  
五星好评  顶一下,感谢分享!
2015-09-20 18:32   回复  
五星好评  顶一下,感谢分享!
2015-09-25 15:17   回复  
五星好评  顶一下,感谢分享!
2015-09-28 21:04   回复  
五星好评  顶一下,感谢分享!
2015-10-08 15:37   回复  
顶一下,感谢分享!
苏几岸41楼
2015-10-09 10:37   回复  
顶一下,感谢分享!
2015-10-17 19:28   回复  
五星好评  顶一下,感谢分享!
2015-12-04 14:05   回复  
五星好评  顶一下,感谢分享!
2015-12-21 09:04   回复  
五星好评  顶一下,感谢分享!
三叶草547楼
2016-01-13 18:40   回复  
五星好评  顶一下,感谢分享!
2016-01-13 19:29   回复  
三星好评  顶一下,感谢分享!
2016-03-10 11:10   回复  
五星好评  顶一下,感谢分享!
相关版块跳转 我要订阅楼主 yaazhaoo 的主题更新
☆ 无星级 ★ 一星级 ★★★ 三星级 ★★★★★ 五星级
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[找工作] 成都产品质量检测研究院 200+3 鲸鱼663 2024-06-11 9/450 2024-06-16 10:08 by SNaiL1995
[有机交流] 车间生产,真空度很高,温度很高,但减压蒸馏速度很慢。 10+12 召唤鬼泣lL 2024-06-13 36/1800 2024-06-16 09:20 by ddc805
[硕博家园] 硕博巨婴,也许才刚刚开始 +30 SNaiL1995 2024-06-12 72/3600 2024-06-16 08:34 by 小龙虾biubiubiu
[教师之家] 关于2023的收入 +33 小龙虾2008 2024-06-10 34/1700 2024-06-15 23:01 by zeolitess
[文学芳草园] 累并快乐着 +13 MYHLD521 2024-06-14 13/650 2024-06-15 22:59 by zeolitess
[基金申请] 关于博后基金的bug问题 +6 lxr1991 2024-06-14 9/450 2024-06-15 21:17 by since—2010
[考博] 上海交大招收材料化学方向科研助理/“申请考核”博士(请勿回复帖子或站内投条) +3 灵梦and紫 2024-06-12 4/200 2024-06-15 20:58 by 1822836277
[基金申请] Nature 11日发文,中国著名学者们称造假迫不得已 +5 babu2015 2024-06-14 5/250 2024-06-15 20:40 by lc231001
[论文投稿] 审稿人含糊拒稿,还需要回复吗?如何回复? 20+3 BruceChum 2024-06-15 17/850 2024-06-15 20:19 by arthas_007
[基金申请] BO4的YQ答辩通知发布了吗? +6 博学笃行 2024-06-11 6/300 2024-06-15 16:04 by 悲催科研狗
[论文投稿] 求机械类四区sci推荐 5+3 迷茫小旷 2024-06-14 4/200 2024-06-15 11:25 by bobvan
[食品] 食品博士导师 +6 小李醒yy 2024-06-11 9/450 2024-06-14 23:37 by 小李醒yy
[论文投稿] 审稿问题:为什么荧光激发波长和紫外吸收波长差的大? 10+4 sdawege 2024-06-14 8/400 2024-06-14 22:39 by 东北读书人
[基金申请] 面上基金有一个(两个)C是不是就没戏了.... 5+3 zzzm116 2024-06-13 17/850 2024-06-14 22:26 by lzt8076
[考研] 物理化学一对一辅导 +3 林大diao 2024-06-12 5/250 2024-06-14 20:57 by 林大diao
[有机交流] ππ堆积会发生在有机溶剂中吗 5+3 zibuyu0420 2024-06-13 4/200 2024-06-14 14:17 by 小肉干
[论文投稿] 投稿kbs被拒后,系统提供的推荐的其他期刊有用吗? +3 chenrui2015 2024-06-10 3/150 2024-06-14 10:30 by Tr.sjx1997
[硕博家园] 机械研究生如何拿到年薪40+w +13 阿巴阿巴哦哦 2024-06-11 15/750 2024-06-13 15:40 by 113745685
[考博] 博导选择 +3 bing85977 2024-06-12 3/150 2024-06-13 15:34 by 我是邱尧
[论文投稿] 摩擦磨损论文投稿 +3 jmysan 2024-06-12 3/150 2024-06-13 08:36 by 莱茵润色
信息提示
请填处理意见