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小小树虫

银虫 (小有名气)

应助: 1 (幼儿园)
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在线: 36.2小时
虫号: 1926735
注册: 2012-08-06
性别: GG
专业: 植物病理学

[交流] 转录组数据挖掘后处理已有2人参与

最近获得一批转录组数据，实验为两个处理：一个为健康对照，一个为病原菌侵染处理。实验目的为寻找病程相关抗病或致病基因。

拟通过已知的相关模式生物抗病基因或致病基因的同源序列在所获得的Unigene中寻找同源性比较高的序列做进一步的功能验证实验。请问有什么好的方法在所有获得的转录组数据 unigene 中比对其序列相似性？

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1楼 2013-05-02 09:24:22

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huanghy346

铁虫 (初入文坛)

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性别: MM
专业: 植物保护生物技术

★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖

引用回帖:

2楼: Originally posted by 小小树虫 at 2013-05-03 15:05:22
没有人会吗

为什么要用同源序列找呢？

3楼2014-07-14 16:13:55

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zhangqifa

新虫 (初入文坛)

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注册: 2014-05-28
专业: 作物种质资源与遗传育种学

我也不会

发自小木虫Android客户端

4楼2016-04-02 00:36:20

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