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cuicchao

金虫 (正式写手)


[交流] 毕赤酵母转化后遗传霉素筛选问题

大家好,这次做了一次酵母的点转化实验,GS115菌株,ppic9k质粒,先在MD平板上长起来之后,方法一:用牙签挑上几十个单克隆转移到0.5mg/ml的遗传霉素G418平板上进行第一个浓度的初筛,3天了,还没东西,着急啊!!!方法二:用无菌水把MD平板上的菌落洗下来,然后涂在0.5mg/ml的遗传霉素G418平板上,这里我想问一下涂G418平板时菌浓度是不是要特别注意,遗传霉素对细胞密度很敏感?????
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HTGe

金虫 (小有名气)


★ ★
cuicchao(金币+1): 谢谢参与
cuicchao(gyesang代发): 金币+1, 鼓励回帖应助! 2013-05-04 19:28:28
补充一下,其实第二种洗平板的方法也是有其优势的,挑单克隆毕竟不能将所有高拷贝转化子一网打尽,这是挑单克隆的弊端,往往很可能你会错过那些最高拷贝的克隆,而洗脱后涂布,只要你G418梯度设置合理、宽泛,就一定能筛到最高拷贝的克隆,我们实验室就是这么做的。第一种方法当然会比较纯,这个确实是一个优势;但,绝大部分用毕赤酵母表达系统的实验都是为了得到高拷贝,这是最终极的目标;不过,如果楼主有足够的耐心与时间,还有足够的G418,完全可以把所有克隆都挑出来,但这个确实很费时费力。两种方法各有优缺点,不能一概而论,更不能执其一端,要依实际情况灵活选择应用。
9楼2013-05-04 11:51:25
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heroxuning

木虫 (正式写手)


引用回帖:
6楼: Originally posted by cuicchao at 2013-05-02 11:23:09
恩,对啊!这几天还想这两种方法的优缺点,我明白了!另外你说说高拷贝的克隆在相对低浓度的G418平板上长得是相比低拷贝的克隆长得快一点吧!...

理论上是这样的,但是你是很难控制好挑的克隆大小很一致,生长起点会不一样
7楼2013-05-02 14:23:47
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heroxuning

木虫 (正式写手)


★ ★
cuicchao(金币+1): 谢谢参与
myprayer: 金币+1, 赠人玫瑰手有余香,鼓励应助,分子生物版块期待你的更多精彩。同样期待你更详细的应助指导。 2013-05-02 12:04:15
可以尝试不同浓度的G418平板,0.25mg/L,0.5mg/L,1.0mg/L,我们实验室都做到2.0,3.0mg/L,高抗的一般长的是比较慢,可以第四天查看一下。另外建议挑转化平板克隆,不建议涂菌液,因为严格意义上讲涂菌液长出来的克隆同一克隆几率会比较大,就是说一个转化平板上的高拷贝克隆可以在G418长出N个克隆,筛选就失去了意义
5楼2013-05-02 11:05:17
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cuicchao

金虫 (正式写手)


引用回帖:
5楼: Originally posted by heroxuning at 2013-05-02 11:05:17
可以尝试不同浓度的G418平板,0.25mg/L,0.5mg/L,1.0mg/L,我们实验室都做到2.0,3.0mg/L,高抗的一般长的是比较慢,可以第四天查看一下。另外建议挑转化平板克隆,不建议涂菌液,因为严格意义上讲涂菌液长出来的克隆同 ...

恩,对啊!这几天还想这两种方法的优缺点,我明白了!另外你说说高拷贝的克隆在相对低浓度的G418平板上长得是相比低拷贝的克隆长得快一点吧!
6楼2013-05-02 11:23:09
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cuicchao

金虫 (正式写手)


引用回帖:
9楼: Originally posted by HTGe at 2013-05-04 11:51:25
补充一下,其实第二种洗平板的方法也是有其优势的,挑单克隆毕竟不能将所有高拷贝转化子一网打尽,这是挑单克隆的弊端,往往很可能你会错过那些最高拷贝的克隆,而洗脱后涂布,只要你G418梯度设置合理、宽泛,就一定 ...

恩,也是的,我都挑了几百个了,不相信我的运气这么差啊,呵呵
10楼2013-05-04 12:09:01
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qiuqiushine

新虫 (初入文坛)



cuicchao(金币+1): 谢谢参与
你好,想请教你怎么做菌落PCR?我的重组0K质粒转入GS115后,在MD上能够长出单菌落,要做菌落PCR验证,应该怎么做呢?因为是初次做这个实验,实验室也没有人做过,所以不知道怎么做,谢谢
11楼2013-12-16 16:13:05
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cuicchao

金虫 (正式写手)


引用回帖:
11楼: Originally posted by qiuqiushine at 2013-12-16 16:13:05
你好,想请教你怎么做菌落PCR?我的重组0K质粒转入GS115后,在MD上能够长出单菌落,要做菌落PCR验证,应该怎么做呢?因为是初次做这个实验,实验室也没有人做过,所以不知道怎么做,谢谢

AOX1引物和目的基因引物做PCR,mut+会出现两条带,muts只是一条带,若用阿尔法FActor和目的基因引物做只会出项一条带,这次我想在MD和MM平板上看看长势在判断一下
12楼2013-12-19 09:49:41
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weiyasong2楼
2013-05-01 13:21   回复  
cuicchao(金币+1): 谢谢参与
gzl99013楼
2013-05-01 13:26   回复  
cuicchao(金币+1): 谢谢参与
祝福祝福祝福祝福祝福祝福!
2013-05-01 22:28   回复  
cuicchao(金币+1): 谢谢参与
haixiawu8楼
2013-05-03 00:04   回复  
cuicchao(金币+1): 谢谢参与
2016-11-12 14:57   回复  
cuicchao(金币+1): 谢谢参与
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2016-11-12 14:57   回复  
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