24小时热门版块排行榜    

Znn3bq.jpeg
查看: 997  |  回复: 6

ylzhao

木虫 (小有名气)

[求助] Cu的赝势测定

各位好!
我最近开始学习使用siesta程序,知道使用某种元素前需要选测试一下赝势。我的体系中有Cu元素,我根据说明书上的指示一步一步做,却发现怎么修改spdf轨道半径截断值也无法达到测试的标准:AE-PT<1mRy,我调试出来的也就是AE-PT<1Ry而已,差得太多了,请教各位同行,如何调试赝势。
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

KalaShayminS

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
ylzhao: 金币+1, 有帮助 2013-05-02 15:31:57
用的初始的参数是怎么来的?是SIESTA官网上的吗?
如果是实际应用的话,直接用SIESTA官网提供的PP,考察一下它对金属Cu的计算是否合理(例如优化晶格常数)也应该可以了。
2楼2013-04-29 10:27:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ylzhao

木虫 (小有名气)

初始文件是inp文件啊,里面设置使用的XC泛函,赝势考虑的轨道,s,p,d,f轨道的截断半径等信息,文件内容不多,说明书上都介绍的。怎么,大家使用siesta的赝势之前不进行测试吗?直接就用啊。。。
我刚调了一个2.8 3.1 2.1 0.0 0.0 0.8的参数,只测试三个态的时候比较准确。
刚找了个人问,说是即使测试完了准确,应用到其他体系的时候也未必准,真纠结。。。
不管了,起码这一步按照程序说明做完了。
3楼2013-04-29 14:39:41
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

yangxuezhang

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
ylzhao: 金币+1, 有帮助 2013-05-02 15:32:09
官网上有的都可以直接用,当然用之前,测试一下,lz不要执着了,赝势牵扯的知识很多,很少有人说得清楚
4楼2013-05-01 15:13:11
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ylzhao

木虫 (小有名气)

我用了官网的Cu的赝势,算了Cu-Cu的构型,但是没有计算成功,最后结果如下:
mesh3D initDistr ERROR: parameter maxDistr too small
Stopping Program from Node:    3
mesh3D initDistr ERROR: parameter maxDistr too small
Stopping Program from Node:    5
mesh3D initDistr ERROR: parameter maxDistr too small
mesh3D initDistr ERROR: parameter maxDistr too small
mesh3D initDistr ERROR: parameter maxDistr too small
Stopping Program from Node:    1
mesh3D initDistr ERROR: parameter maxDistr too small
Stopping Program from Node:    4
Stopping Program from Node:    6
mesh3D initDistr ERROR: parameter maxDistr too small
Stopping Program from Node:    7
mesh3D initDistr ERROR: parameter maxDistr too small
Stopping Program from Node:    2
Stopping Program from Node:    0
请问是什么原因?我的参数哪里设置的不对?
5楼2013-05-02 09:06:45
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

ylzhao

木虫 (小有名气)

SystemName   Cu2
SystemLabel  Cu2

NumberOfAtoms      2
NumberOfSpecies    1
%block ChemicalSpeciesLabel
1  29 Cu_dou
%endblock ChemicalSpeciesLabel

# Basis sets
PAO.BasisSize       DZP
PAO.EnergyShift     25 meV            #about 100ev
PAO.SplitNorm       0.15

xc.functional         VDW           # Exchange-correlation functional
xc.authors            DRSLL         # Exchange-correlation version
SpinPolarized          F

AtomicCoordinatesFormat   Ang
%block AtomicCoordinatesAndAtomicSpecies
8.60840069    7.20199525    0.00000000   1
6.40628675    7.79283718    0.00000000   1
%endblock AtomicCoordinatesAndAtomicSpecies

# SCF options #
ElectronicTemperature   0.000 eV
MaxSCFIterations   500
MeshCutoff       100.0000 Ry
DM.Tolerance        0.0001

# MD options #
MD.TypeOfRun        cg
MD.NumCGsteps        500
MD.MaxForceTol     0.02 eV/Ang
MD.VariableCell      T

# DOS options #
#WriteMullikenPop         1
WriteDenchar             T
#WriteKpoints            T
WriteForces              T
#WriteDM                 T
#WriteXML                T
#WriteBands              F
#WriteKbands             F
WriteEigenvalues         T
#WriteCoorStep           T
#WriteMDhistory          T
WriteMDXmol              T
#WriteWaveFunctions      F
#WriteCoorXmol           T

我的input.fdf文件内容如上所示,请各位指点迷津,谢谢。
6楼2013-05-02 09:12:12
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

KalaShayminS

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


ben_ladeng: 金币+1, 谢谢 2013-05-02 19:50:45
引用回帖:
6楼: Originally posted by ylzhao at 2013-05-02 09:12:12
SystemName   Cu2
SystemLabel  Cu2

NumberOfAtoms      2
NumberOfSpecies    1
%block ChemicalSpeciesLabel
1  29 Cu_dou
%endblock ChemicalSpeciesLabel

# Basis sets
PAO.BasisSize       DZP
P ...

这个错误可能是vdw/DRSLL本身的问题,先尝试用PBE计算一下能否通过。
7楼2013-05-02 09:28:51
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
相关版块跳转 我要订阅楼主 ylzhao 的主题更新
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[教师之家] 论文撤稿了 +4 bjvtcliu 2026-05-24 7/350 2026-05-24 17:29 by bjvtcliu
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 hvkbtfonbv 2026-05-23 4/200 2026-05-24 17:21 by 75ui6h7z2t
[博后之家] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 hvkbtfonbv 2026-05-23 3/150 2026-05-24 17:10 by 75ui6h7z2t
[考博] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 hvkbtfonbv 2026-05-23 3/150 2026-05-24 17:01 by 75ui6h7z2t
[考研] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 a2tycdlnq1 2026-05-23 5/250 2026-05-24 16:21 by hhx1yx9evi
[论文投稿] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +3 a2tycdlnq1 2026-05-23 4/200 2026-05-24 16:16 by hhx1yx9evi
[基金申请] 河北省自然科学基金 +6 Peterchao 2026-05-18 9/450 2026-05-24 16:02 by 130067131
[硕博家园] 售SCI一区T0P文章,我:8.O.5.5.1.O.5.4,科目齐全,可+急 +4 pmo95bazuy 2026-05-23 8/400 2026-05-24 15:56 by 1uy1ht2y9r
[基金申请] 西安交大新媒学院副院长用撤稿论文结题 +3 bjvtcliu 2026-05-24 5/250 2026-05-24 10:16 by kudofaye
[教师之家] 某211大学教师把个人教师官方主页改成:我跑了我跑了我跑了!官宣跑路! +4 zju2000 2026-05-21 5/250 2026-05-24 09:35 by songwz
[考博] 26/27申博自荐 10+4 ZXW0202 2026-05-22 9/450 2026-05-24 08:47 by bjvtcliu
[基金申请] 青B发送上会通知了吗 +5 chemBioBro 2026-05-22 7/350 2026-05-23 12:35 by zhuifengzhy
[考博] 博士申请 +3 焦晓明 2026-05-21 3/150 2026-05-23 11:26 by mlc840311
[论文投稿] 投稿求助,期刊 +4 希冀,有书读 2026-05-20 8/400 2026-05-22 10:16 by 希冀,有书读
[基金申请] 国自然上会要求 +7 无名者登山 2026-05-18 11/550 2026-05-21 15:50 by draco1987
[基金申请] 提交了我也来说说感想 +9 fummck 2026-05-20 10/500 2026-05-21 14:17 by draco1987
[有机交流] 反应很差,大量原料没有反应 5+3 Mr.Zot 2026-05-19 8/400 2026-05-20 22:19 by Equinoxhua
[考博] 如果工作了想读博,可以边工作边读全日制嘛? 30+3 铁达火车 2026-05-18 5/250 2026-05-20 09:33 by tfang
[考博] 博士申请 +5 星…… 2026-05-18 6/300 2026-05-18 23:49 by 糊糊涂涂好
[硕博家园] 我在等一个没有答案的答案 +3 Love_MH 2026-05-17 3/150 2026-05-18 02:22 by 竹林孤影
信息提示
请填处理意见