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ylzhao

木虫 (小有名气)

[求助] Cu的赝势测定

各位好!
我最近开始学习使用siesta程序,知道使用某种元素前需要选测试一下赝势。我的体系中有Cu元素,我根据说明书上的指示一步一步做,却发现怎么修改spdf轨道半径截断值也无法达到测试的标准:AE-PT<1mRy,我调试出来的也就是AE-PT<1Ry而已,差得太多了,请教各位同行,如何调试赝势。
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KalaShayminS

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
ylzhao: 金币+1, 有帮助 2013-05-02 15:31:57
用的初始的参数是怎么来的?是SIESTA官网上的吗?
如果是实际应用的话,直接用SIESTA官网提供的PP,考察一下它对金属Cu的计算是否合理(例如优化晶格常数)也应该可以了。
2楼2013-04-29 10:27:09
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ylzhao

木虫 (小有名气)

初始文件是inp文件啊,里面设置使用的XC泛函,赝势考虑的轨道,s,p,d,f轨道的截断半径等信息,文件内容不多,说明书上都介绍的。怎么,大家使用siesta的赝势之前不进行测试吗?直接就用啊。。。
我刚调了一个2.8 3.1 2.1 0.0 0.0 0.8的参数,只测试三个态的时候比较准确。
刚找了个人问,说是即使测试完了准确,应用到其他体系的时候也未必准,真纠结。。。
不管了,起码这一步按照程序说明做完了。
3楼2013-04-29 14:39:41
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yangxuezhang

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
ylzhao: 金币+1, 有帮助 2013-05-02 15:32:09
官网上有的都可以直接用,当然用之前,测试一下,lz不要执着了,赝势牵扯的知识很多,很少有人说得清楚
4楼2013-05-01 15:13:11
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ylzhao

木虫 (小有名气)

我用了官网的Cu的赝势,算了Cu-Cu的构型,但是没有计算成功,最后结果如下:
mesh3D initDistr ERROR: parameter maxDistr too small
Stopping Program from Node:    3
mesh3D initDistr ERROR: parameter maxDistr too small
Stopping Program from Node:    5
mesh3D initDistr ERROR: parameter maxDistr too small
mesh3D initDistr ERROR: parameter maxDistr too small
mesh3D initDistr ERROR: parameter maxDistr too small
Stopping Program from Node:    1
mesh3D initDistr ERROR: parameter maxDistr too small
Stopping Program from Node:    4
Stopping Program from Node:    6
mesh3D initDistr ERROR: parameter maxDistr too small
Stopping Program from Node:    7
mesh3D initDistr ERROR: parameter maxDistr too small
Stopping Program from Node:    2
Stopping Program from Node:    0
请问是什么原因?我的参数哪里设置的不对?
5楼2013-05-02 09:06:45
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ylzhao

木虫 (小有名气)

SystemName   Cu2
SystemLabel  Cu2

NumberOfAtoms      2
NumberOfSpecies    1
%block ChemicalSpeciesLabel
1  29 Cu_dou
%endblock ChemicalSpeciesLabel

# Basis sets
PAO.BasisSize       DZP
PAO.EnergyShift     25 meV            #about 100ev
PAO.SplitNorm       0.15

xc.functional         VDW           # Exchange-correlation functional
xc.authors            DRSLL         # Exchange-correlation version
SpinPolarized          F

AtomicCoordinatesFormat   Ang
%block AtomicCoordinatesAndAtomicSpecies
8.60840069    7.20199525    0.00000000   1
6.40628675    7.79283718    0.00000000   1
%endblock AtomicCoordinatesAndAtomicSpecies

# SCF options #
ElectronicTemperature   0.000 eV
MaxSCFIterations   500
MeshCutoff       100.0000 Ry
DM.Tolerance        0.0001

# MD options #
MD.TypeOfRun        cg
MD.NumCGsteps        500
MD.MaxForceTol     0.02 eV/Ang
MD.VariableCell      T

# DOS options #
#WriteMullikenPop         1
WriteDenchar             T
#WriteKpoints            T
WriteForces              T
#WriteDM                 T
#WriteXML                T
#WriteBands              F
#WriteKbands             F
WriteEigenvalues         T
#WriteCoorStep           T
#WriteMDhistory          T
WriteMDXmol              T
#WriteWaveFunctions      F
#WriteCoorXmol           T

我的input.fdf文件内容如上所示,请各位指点迷津,谢谢。
6楼2013-05-02 09:12:12
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KalaShayminS

铁杆木虫 (著名写手)

【答案】应助回帖


ben_ladeng: 金币+1, 谢谢 2013-05-02 19:50:45
引用回帖:
6楼: Originally posted by ylzhao at 2013-05-02 09:12:12
SystemName   Cu2
SystemLabel  Cu2

NumberOfAtoms      2
NumberOfSpecies    1
%block ChemicalSpeciesLabel
1  29 Cu_dou
%endblock ChemicalSpeciesLabel

# Basis sets
PAO.BasisSize       DZP
P ...

这个错误可能是vdw/DRSLL本身的问题,先尝试用PBE计算一下能否通过。
7楼2013-05-02 09:28:51
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