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finnchan

金虫 (小有名气)


[交流] 晶体解析过程的信息判断

刚刚学习晶体解析,遇到很多的问题,身边没有懂的人请教,所以只能盼望虫友不吝赐教了。
问题一:Xshell中密密麻麻的Q峰,我该删除哪些呢?根据什么来判断啊?我指认了几个Q峰,修一轮后,为什么发现新出来的Q峰突然变得很小呢?指认后的Q峰 我依据什么断定指认的正确与否呢?
问题二:修一轮后,程序提供的一些信息该怎么分析呢?例如,我上传的图片中,都传递了哪些提示信息?接下来我该怎么做?
希望能有高手帮助,越详细越好啊!万分感谢!

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meizi0314

铜虫 (小有名气)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
在你的.lis文件里看Q峰,最后一列,如果大于2,就要只认为原子,如果小于2,可以不用管。如果指认为原子精修后goof值变小,说明指认对了。
9楼2013-04-23 11:10:17
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qianbh

至尊木虫 (著名写手)


★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
finnchan: 金币+5, 谢谢 2013-04-23 13:57:44
一、不是先删除,而是先指认最有把握的原子,其依据是你所预期的结构。指认部分原子后,再删除暂时不能指认的原子,精修后再重复上述操作。
二、精修一轮后,从上述的信息中,一是看Goof=S=后的值是否趋近1,其次Mean shift/esd的值越来越小。同时Highest peak(deepest hole)趋于0等。
三、要多实践,没有一个固定的步骤能解决所用问题。
以上是个人的一点体会,不知正确与否,请指正!
2楼2013-04-23 08:14:42
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gzl9901

铁杆木虫 (文坛精英)



小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
祝福,祝福,祝福!美好的未来在向你招手!!!
3楼2013-04-23 08:23:59
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etongtong

铁杆木虫 (著名写手)


★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
finnchan: 金币+2, 谢谢, 2013-04-23 09:15:28
1有重原子先指定它
2随后指定刚性骨架
3然后将不重的原子的Q峰先删除
4再算一遍,看看是否可以将上述原子连接起来
5以上的前提是你 的空间群是对的
呵呵,祝你好运。
5楼2013-04-23 08:34:33
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zhihaikou10楼
2013-04-23 11:53   回复  
祝福祝福!!!!
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