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晶体解析过程的信息判断
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finnchan
金虫
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[交流]
晶体解析过程的信息判断
刚刚学习晶体解析,遇到很多的问题,身边没有懂的人请教,所以只能盼望虫友不吝赐教了。
问题一:Xshell中密密麻麻的Q峰,我该删除哪些呢?根据什么来判断啊?我指认了几个Q峰,修一轮后,为什么发现新出来的Q峰突然变得很小呢?指认后的Q峰 我依据什么断定指认的正确与否呢?
问题二:修一轮后,程序提供的一些信息该怎么分析呢?例如,我上传的图片中,都传递了哪些提示信息?接下来我该怎么做?
希望能有高手帮助,越详细越好啊!万分感谢!
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2013-04-22 20:31:25
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etongtong
铁杆木虫
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finnchan: 金币+2, 谢谢,
2013-04-23 09:15:28
1有重原子先指定它
2随后指定刚性骨架
3然后将不重的原子的Q峰先删除
4再算一遍,看看是否可以将上述原子连接起来
5以上的前提是你 的空间群是对的
呵呵,祝你好运。
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5楼
2013-04-23 08:34:33
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qianbh
至尊木虫
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finnchan: 金币+5, 谢谢
2013-04-23 13:57:44
一、不是先删除,而是先指认最有把握的原子,其依据是你所预期的结构。指认部分原子后,再删除暂时不能指认的原子,精修后再重复上述操作。
二、精修一轮后,从上述的信息中,一是看Goof=S=后的值是否趋近1,其次Mean shift/esd的值越来越小。同时Highest peak(deepest hole)趋于0等。
三、要多实践,没有一个固定的步骤能解决所用问题。
以上是个人的一点体会,不知正确与否,请指正!
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2楼
2013-04-23 08:14:42
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gzl9901
铁杆木虫
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小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
祝福,祝福,祝福!美好的未来在向你招手!!!
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3楼
2013-04-23 08:23:59
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finnchan
金虫
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引用回帖:
2楼
:
Originally posted by
qianbh
at 2013-04-23 08:14:42
一、不是先删除,而是先指认最有把握的原子,其依据是你所预期的结构。指认部分原子后,再删除暂时不能指认的原子,精修后再重复上述操作。
二、精修一轮后,从上述的信息中,一是看Goof=S=后的值是否趋近1,其次M ...
针对上面的精修结果,能看出有哪里需要改进吗?哪些原子指定是对的,哪些指认是错的?接下来需要怎么操作? 谢谢,希望能够进一步解答。非常感谢!
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6楼
2013-04-23 09:14:53
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zhihaikou
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2013-04-23 11:53
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祝福祝福!!!!
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