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finnchan

金虫 (小有名气)

[交流] 晶体解析过程的信息判断

刚刚学习晶体解析，遇到很多的问题，身边没有懂的人请教，所以只能盼望虫友不吝赐教了。
问题一：Xshell中密密麻麻的Q峰，我该删除哪些呢？根据什么来判断啊？我指认了几个Q峰，修一轮后，为什么发现新出来的Q峰突然变得很小呢？指认后的Q峰 我依据什么断定指认的正确与否呢？
问题二：修一轮后，程序提供的一些信息该怎么分析呢？例如，我上传的图片中，都传递了哪些提示信息？接下来我该怎么做？
希望能有高手帮助，越详细越好啊！万分感谢！

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1楼 2013-04-22 20:31:25
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gzl9901

铁杆木虫 (文坛精英)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
祝福，祝福，祝福！美好的未来在向你招手！！！
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3楼2013-04-23 08:23:59
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qianbh

至尊木虫 (著名写手)
★ ★ ★ ★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
finnchan: 金币+5, 谢谢 2013-04-23 13:57:44
一、不是先删除，而是先指认最有把握的原子，其依据是你所预期的结构。指认部分原子后，再删除暂时不能指认的原子，精修后再重复上述操作。
二、精修一轮后，从上述的信息中，一是看Goof=S=后的值是否趋近1，其次Mean shift/esd的值越来越小。同时Highest peak(deepest hole)趋于0等。
三、要多实践，没有一个固定的步骤能解决所用问题。
以上是个人的一点体会，不知正确与否，请指正！
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2楼2013-04-23 08:14:42
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etongtong

铁杆木虫 (著名写手)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
finnchan: 金币+2, 谢谢， 2013-04-23 09:15:28
1有重原子先指定它
2随后指定刚性骨架
3然后将不重的原子的Q峰先删除
4再算一遍，看看是否可以将上述原子连接起来
5以上的前提是你 的空间群是对的
呵呵，祝你好运。
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5楼2013-04-23 08:34:33
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finnchan

金虫 (小有名气)
引用回帖:
2楼: Originally posted by qianbh at 2013-04-23 08:14:42
一、不是先删除，而是先指认最有把握的原子，其依据是你所预期的结构。指认部分原子后，再删除暂时不能指认的原子，精修后再重复上述操作。
二、精修一轮后，从上述的信息中，一是看Goof=S=后的值是否趋近1，其次M ...

针对上面的精修结果，能看出有哪里需要改进吗？哪些原子指定是对的，哪些指认是错的？接下来需要怎么操作？  谢谢，希望能够进一步解答。非常感谢！
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6楼2013-04-23 09:14:53
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zhihaikou10楼
2013-04-23 11:53   回复  
祝福祝福！！！！
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