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showerywong

新虫 (初入文坛)

[求助] 酶蛋白突变体稳定性的预测软件,求助,谢谢

各位老师,小弟在此发帖求助了!我的标题可能描述得不清楚

问题描述:我现在所做的课题是酶蛋白的基因改造,其中我尝试过易错PCR,但是效果不好,没有筛选到正向突变的突变基因。最近看到一篇文献,介绍一种算法可以模拟蛋白点突变,然后进行稳定性评估,从而计算出最适合突变的位点。根据模拟的结果,设计酶蛋白突变的位点,最后通过实验来筛选酶学性质更好的突变酶。

但是现在苦于编程水平不高,无法将上述文献中的方法弄成软件。想求助各位老师,有没有类似的软件或者网页服务器。

软件或者网页服务器要求:输入一个蛋白序列(或者PDB文件)→每个位点依次进行点突变→突变体的评估→统计出适合进行突变研究的位点。(类似的亦可)

谢谢各位老师,我金币不多,有任何合适的方法都行。不一定仅限于软件预测。易错PCR我已经做过,没有太好的结果。DNA-shuffling需要很多同源性高的基因来进行(目前我只有一个基因)。点饱和突变操作起来也不简单。

任何好方法对我都是巨大的帮助,请各位大牛不吝赐教!小弟在此感激不尽!

PS:略懂Linux操作;酶基因为1374bp
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三月未央

铜虫 (初入文坛)

同样的处境!我也是苦于不知道如何确定氨基酸突变点。你看到的那篇文献可以分享一下吗?
2楼2014-09-12 17:03:18
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