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尼尔墨客

铜虫 (小有名气)

[求助] 非模式植物怎么研究信号通路

课题无从下手,研究一种非模式植物,没有突变体,如何研究某一种信号通路,测序吗
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starseacow

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【答案】应助回帖

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尼尔墨客: 金币+10, ★★★★★最佳答案 2013-08-22 20:48:26
楼主问题提的太大了,最好给出点具体信息。
我在另一个帖子里看到你在做激素信号通路,我感觉在你做这个项目前,应该先明确为什么在这个非模式植物上研究该信号通路,对于该非模式植物上,已经有哪些研究成果,另外,在拟南芥上的相关研究有什么,你的工作能否提供不同的信息,如果你的研究很难提供一些新鲜结果,我很担心最后是事倍功半。
至于具体做法,可以先从外加激素信号通路相关抑制剂开始,看看在你的职植物上有什么反应,与拟南芥的报道是否一致。对于研究课题,也最好圈定的小一点,比如说具体到ROS与该激素在你研究植物中的信号调节作用
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2楼2013-08-22 18:56:33
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starseacow

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5楼: Originally posted by 尼尔墨客 at 2013-08-22 21:53:46
我看到你发了一些关于ROS的文献,请教下测一些植物内活性氧的相关指标能否说明植物的抗逆性强?还有你是否做过一氧化氮方面的研究?...

这方面都做过,活性氧是一种重要的小分子信号物质,活性氧迸发可以作为一个植物逆境的标志,也有报道将抗氧化酶系统水平作为抗逆性的标志。但单纯活性氧说明不了什么问题,就我感觉,几乎左右植物生理活动都或多或少可以和活性氧迸发挂上钩,因此需要一个比较全面深入的实验设计,真正利用活性氧数据说明问题。
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6楼2013-08-22 22:04:16
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尼尔墨客

铜虫 (小有名气)

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2楼: Originally posted by starseacow at 2013-08-22 18:56:33
楼主问题提的太大了,最好给出点具体信息。
我在另一个帖子里看到你在做激素信号通路,我感觉在你做这个项目前,应该先明确为什么在这个非模式植物上研究该信号通路,对于该非模式植物上,已经有哪些研究成果,另外 ...

谢谢 我研究一种高海拔抗逆性强的草本植物 主要想研究内源激素和一些信号分子如何调控该植物发育过程 大概思路是这样 但是不知道怎么入手 我研究的植物没有这方面的研究 看了好多模式植物从突变体为材料研究  看了一些文献提到生长素调控发育 但是在非模式植物上该怎么证明 是不是只有测序
3楼2013-08-22 20:58:04
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starseacow

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3楼: Originally posted by 尼尔墨客 at 2013-08-22 20:58:04
谢谢 我研究一种高海拔抗逆性强的草本植物 主要想研究内源激素和一些信号分子如何调控该植物发育过程 大概思路是这样 但是不知道怎么入手 我研究的植物没有这方面的研究 看了好多模式植物从突变体为材料研究  看了 ...

不知道你所说的测序是打算测什么。在资料比较有限的情况下,我考虑可以先从简单的实验入手,通过外加一些抑制剂或清除剂,看看抑制该内源激素或信号分子后,对植物抗逆性有什么样的影响。再确认激素,信号拔子以及你的植物特有的高海拔抗逆性以后,在考虑下一步深入工作。譬如寻找编码或调控该激素合成与功能的基因之类,但这样工作量会很大,得先找一个小突破口一步一步来。
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4楼2013-08-22 21:16:48
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尼尔墨客

铜虫 (小有名气)

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4楼: Originally posted by starseacow at 2013-08-22 21:16:48
不知道你所说的测序是打算测什么。在资料比较有限的情况下,我考虑可以先从简单的实验入手,通过外加一些抑制剂或清除剂,看看抑制该内源激素或信号分子后,对植物抗逆性有什么样的影响。再确认激素,信号拔子以及 ...

我看到你发了一些关于ROS的文献,请教下测一些植物内活性氧的相关指标能否说明植物的抗逆性强?还有你是否做过一氧化氮方面的研究?
5楼2013-08-22 21:53:46
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尼尔墨客

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6楼: Originally posted by starseacow at 2013-08-22 22:04:16
这方面都做过,活性氧是一种重要的小分子信号物质,活性氧迸发可以作为一个植物逆境的标志,也有报道将抗氧化酶系统水平作为抗逆性的标志。但单纯活性氧说明不了什么问题,就我感觉,几乎左右植物生理活动都或多或 ...

关于一氧化氮我用荧光探针在共聚焦显微镜下观测,本来实验设计的胁迫下荧光应该增强也不明显,不知道你做过这方面不,还有一氧化氮怎么定量测定
7楼2013-08-22 22:20:25
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starseacow

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7楼: Originally posted by 尼尔墨客 at 2013-08-22 22:20:25
关于一氧化氮我用荧光探针在共聚焦显微镜下观测,本来实验设计的胁迫下荧光应该增强也不明显,不知道你做过这方面不,还有一氧化氮怎么定量测定...

最简单的用格里斯试剂测,我以前做过,但说实话效果一般,数据重复性和稳定性不是太好。DAF-2 DA还是最佳选择,方便直观。
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8楼2013-08-22 22:23:10
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尼尔墨客

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8楼: Originally posted by starseacow at 2013-08-22 22:23:10
最简单的用格里斯试剂测,我以前做过,但说实话效果一般,数据重复性和稳定性不是太好。DAF-2 DA还是最佳选择,方便直观。...

你看的是叶片还是根还是什么结构 是直接探针装载后加上盖玻片观测吗 我只能看到表皮毛上有绿色荧光 内部结构都看不到 文献里也没说怎么处理材料
9楼2013-08-22 23:27:33
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starseacow

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我用DAF2DA观察过发根和悬浮细胞,将植物材料置于10 uM探针中,培养2 h,然后加各种处理,荧光显微镜下观察
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10楼2013-08-22 23:36:43
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