24小时热门版块排行榜

>论坛更新日志 (4576)
>虫友互识 (594)
>导师招生 (500)
>文献求助 (312)
>找工作 (289)
>论文投稿 (257)
>职场人生 (245)
>休闲灌水 (167)
>考博 (153)
>考研 (107)
>硕博家园 (100)
>博后之家 (88)
>学术会议 (85)
>招聘信息布告栏 (69)
>医学 (64)
>有机交流 (32)

返回列表

lsc84

铁杆木虫 (职业作家)

应助: 1 (幼儿园)
金币: 6764
散金: 511
红花: 5
帖子: 3083
在线: 388小时
虫号: 646907
注册: 2008-11-05
性别: GG
专业: 物理无机化学

[求助] ORCA跨节点并行问题

我用1台pc机做服务器，4台pc机做计算，用pbsodes查看。
tc1a
   state = job-exclusive
   np = 2
   properties = 10.2.1.130
   ntype = cluster
   jobs = 0/41.compuchem, 1/41.compuchem
   status = rectime=1366182092,varattr=,jobs=41.compuchem,state=free,netload=229818960,gres=,loadave=1.99,ncpus=2,physmem=4025964kb,availmem=23454484kb,totmem=23556708kb,idletime=18185,nusers=1,nsessions=2,sessions=1623 1632,uname=Linux tc1a 2.6.32-5-amd64 #1 SMP Mon Feb 25 00:26:11 UTC 2013 x86_64,opsys=linux

tc1b
   state = job-exclusive
   np = 2
   properties = 10.2.1.131
   ntype = cluster
   jobs = 0/41.compuchem, 1/41.compuchem
   status = rectime=1366182089,varattr=,jobs=41.compuchem,state=free,netload=239624442,gres=,loadave=2.00,ncpus=2,physmem=4025964kb,availmem=23489840kb,totmem=23556708kb,idletime=18172,nusers=1,nsessions=1,sessions=1719,uname=Linux tc1b 2.6.32-5-amd64 #1 SMP Mon Feb 25 00:26:11 UTC 2013 x86_64,opsys=linux

tc1c
   state = job-exclusive
   np = 2
   properties = 10.2.1.132
   ntype = cluster
   jobs = 0/41.compuchem, 1/41.compuchem
   status = rectime=1366182115,varattr=,jobs=41.compuchem,state=free,netload=1164515836,gres=,loadave=1.99,ncpus=2,physmem=4025964kb,availmem=23451644kb,totmem=23556708kb,idletime=6050,nusers=1,nsessions=1,sessions=2020,uname=Linux tc1c 2.6.32-5-amd64 #1 SMP Mon Feb 25 00:26:11 UTC 2013 x86_64,opsys=linux

tc1d
   state = job-exclusive
   np = 2
   properties = 10.2.1.133
   ntype = cluster
   jobs = 0/29.compuchem, 1/29.compuchem
   status = rectime=1366182100,varattr=,jobs=29.compuchem,state=free,netload=3698879470,gres=,loadave=2.00,ncpus=2,physmem=4025964kb,availmem=23006192kb,totmem=23556708kb,idletime=16294,nusers=1,nsessions=1,sessions=1573,uname=Linux tc1d 2.6.32-5-amd64 #1 SMP Mon Feb 25 00:26:11 UTC 2013 x86_64,opsys=linux
   采用2台机子4核计算，不报错，但一直在orca_gtoint_mpi上运行。打开输出文件看，其文件就停在One electron integrals这里不动。
不知道是什么原因？是ORCA不能做多机并行计算？还是jop文件编辑不对？
部分jop文件为：
#!/bin/bash
#PBS -S /bin/bash
#PBS -j oe
#PBS -l nodes=2:ppn=2
#PBS -l walltime=2400:00:00
#PBS -V
#PBS -q batch
cat "$PBS_NODEFILE"
   非常感谢大家的关注！

回复此楼