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zhoujlhn

铜虫 (初入文坛)

[求助] 猪粪中细菌总DNA的提取

小弟最近在提取猪粪中细菌的总DNA,老板说要自己摸索方法,没有考虑过用试剂盒,但是怎么提都没有提出来,请教各位前辈,有谁做过这一块的,请你给小弟我支支招!先谢谢了!下面是我用的方法:
样品的前处理:
称取0.3g粪样放入2ml离心管中,加入1.5mlPBS(ph8.0)溶液,旋涡振荡混匀,4℃,800rpm离心10min;吸上清液转入另一干净2ml离心管中,4℃, 1000rpm离心 10min;再将上清液转入另一干净 2ml离心管中,重复此步骤,直至离心后上清液有菌体浑浊感为止;最后将上清液4℃,13000rpm离心5分钟,弃上清,收集沉淀。将沉淀用适量丙酮洗涤,并转入到 1.5ml离心管中,旋涡振荡混匀, 4℃,13000rpm离心5分钟,弃上清。用丙酮洗涤两次后,收集沉淀自然干燥或吹干
细胞裂解及DNA抽提:
1、        经过前处理后的样品,加600μL TE,20μL溶菌酶 (100mg/ml),轻轻颠倒混匀,于37℃放置 30min;
2、        加入15μL蛋白酶K,500μL裂解液,55℃温浴3-4h,每 20min轻轻颠倒混匀一次;
3、        然后加等体积的酚/氯仿/异戊醇(25:24:1),轻轻混成乳浊液, 4℃,13000rpm离心10min,小心吸上相至空管中;
4、        再加等体积的氯仿/异戊醇(24:l)轻轻颠倒混匀,13000rpm离心 10min,小心吸上相至空管中;加等体积的异丙醇,-20℃沉淀过夜;
5、        将DNA样品取出,13000rpm离心20min,倒去异丙醇,用80%异丙醇洗涤一次,13000rpm离心 10min,弃上清,并将异丙醇吹干;
6、        将DNA溶于60μL TE,0.8%琼脂糖凝胶电泳检测,于-70℃保存.
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一个人的奋斗!!!
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likewind_z

金虫 (小有名气)

既然结果里提到RNA很多,为什么步骤里没有RNA酶的处理?
10楼2013-04-13 16:29:54
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馨沁

木虫 (小有名气)

【答案】应助回帖

感谢参与,应助指数 +1
反复冻融一下试试吧
2楼2013-04-11 21:31:08
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枫林雨

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★
感谢参与,应助指数 +1
zhang8826857: 金币+1, 手机回复,不容易 2013-04-13 22:22:04
要进行预备处理,去除色素,抑制性物质等。用PBS溶液处理等,你可以参考下土壤总DNA的提取预处理。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
喜欢跑步、羽毛球还有暖心的文字。
3楼2013-04-11 22:59:29
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zhoujlhn

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by 馨沁 at 2013-04-11 21:31:08
反复冻融一下试试吧

按照这个方法RNA到提取出了好多,DNA没有出来
一个人的奋斗!!!
4楼2013-04-12 09:17:53
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