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DougSong

木虫 (著名写手)

[求助] 已经知道某蛋白的序列,怎样才能知道它的信号肽区?

我已经知道某蛋白的序列,但我怎样才能知道它的信号肽区signal peptide
,外功能区HA ectodomain,跨膜区transmembrane
domain (TM) and细胞质尾部区域 cytoplasmic domain (CTD)分别对应哪些氨基酸,还有这些氨基酸的数量?多谢
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robustli

银虫 (小有名气)

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感谢参与,应助指数 +1
DougSong: 金币+100, ★★★很有帮助, 50 2013-04-11 03:14:28
you can use some on-line tool to prediction,
for signal peptide please see this website
http://www.csbio.sjtu.edu.cn/bioinf/Signal-3L/     or    http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/
for transmembrane domain, use the following website to predict
http://www.sbc.su.se/~miklos/DAS/  or
http://minnou.cchmc.org/
or
http://smart.embl-heidelberg.de/
these prediction can lab the possible signal peptide region, transmembrane region.
immunologyparasite
2楼2013-04-11 01:52:41
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情景处理

新虫 (初入文坛)

大神,我也想知道,我已知一段序列,在动物细胞内表达出来的时候,肯定进行了修饰,端肽或者说是信号肽肯定被切了,那么我怎么知道表达出的蛋白的实际氨基酸序列呢?
3楼2018-12-13 10:40:40
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