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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 第一性原理 » Vasp&MedeA » 结构优化时报错
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lbing9002

木虫 (正式写手)

[交流] 结构优化时报错

大家看看这是什么问题
用vasp计算，优化结构时出现的

grehehjjyuk.jpg



[ 来自科研家族 计算材料学 ]
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1楼 2013-04-04 08:58:17
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wzbhit

至尊木虫 (著名写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
你用的什么版本的vasp， 重来没见过这个error ，有点意思，方便的话你的INCAR POSCAR贴出来看看呗
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2楼2013-04-04 10:20:13
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171713294

木虫 (正式写手)
★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
把你的INCAR贴出来看看，
赞一下 回复此楼
3楼2013-04-04 11:14:50
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lbing9002

木虫 (正式写手)
脚本：
#!/bin/sh

######### optimize for lattice constant of 32u 68o #############

rm WAVECAR
rm POSCAR
for i in 6.5 7 7.5 8 8.5 9 9.5 10 10.5
do
cat >POSCAR< 32 U   68 O  
$i
1 0 0
0 1 0
0 0 1
U    O   
   32   68
Direct
    0.000000    0.000000    0.000000
    0.251474    0.251474    0.000000
.........
.........
.........

!
echo "a=$i" ;  ~/vasp5_mpi
E=`tail -1 OSZICAR` ; echo $i $E >> summary.out
done
cat summary.out
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4楼2013-04-04 19:43:39
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lbing9002

木虫 (正式写手)
★ ★
franch: 金币+2, 谢谢回帖交流，， 2013-04-08 21:02:02
如果直接运行则没有问题，用脚本运行就会报错，是不是脚本的问题啊
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5楼2013-04-04 19:44:28
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chinguk2004

新虫 (初入文坛)
★ ★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包，谢谢回帖
lbing9002(franch代发): 金币+2, 谢谢回帖交流，， 2013-04-08 21:02:16
引用回帖:
4楼: Originally posted by lbing9002 at 2013-04-04 19:43:39
脚本：
#!/bin/sh

######### optimize for lattice constant of 32u 68o #############

rm WAVECAR
rm POSCAR
for i in 6.5 7 7.5 8 8.5 9 9.5 10 10.5
do
cat >POSCAR<<!
32 U   68 O  
$i ...

调用vasp5_mpi应该指定节点数目，例如：mpirun -np 8 ~/basp5_mpi > log
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6楼2013-04-04 20:15:51
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lbing9002

木虫 (正式写手)
引用回帖:
6楼: Originally posted by chinguk2004 at 2013-04-04 20:15:51
调用vasp5_mpi应该指定节点数目，例如：mpirun -np 8 ~/basp5_mpi > log...

这个指定了...不过刚才写的时候用~代替了...

话说-np是什么意思？我们用的是-n.这两个有什么区别吗？
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7楼2013-04-04 20:33:18
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