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关于构建进化树遇到的问题,急急!
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xubaobao
木虫
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专业: 环境微生物学
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求助
]
关于构建进化树遇到的问题,急急!
将不同属的序列一起做完进化树之后,不同属的序列竟然去了同一枝,与已知序列不在同一枝,请问这是怎么回事?做了好几次一直都是这样,毕业,急啊!谢谢虫子们了。
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1楼
2013-03-27 22:59:49
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rommel1941
铁杆木虫
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情定山河
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专业: 分子与进化生态学
【答案】应助回帖
★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
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xubaobao: 金币+5
2013-03-29 00:11:46
wizardfan: 金币+2, 谢谢分析
2013-03-29 08:02:04
估计是你所得的序列中所含信息量很少,大都是不变位点。或是你选用的model有问题。如果你选用的几种建树方法均一致的话,建议改变分析思路,或者换Marker。希望你把问题说的再明白一点。祝好
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将相本无种★男儿当自强
7楼
2013-03-28 17:20:56
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wpwupingwp
木虫
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性别: GG
专业: 生物信息学
你用什么序列做的?
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南无观世音菩萨
2楼
2013-03-27 23:07:26
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xubaobao
木虫
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专业: 环境微生物学
引用回帖:
2楼
:
Originally posted by
wpwupingwp
at 2013-03-27 23:07:26
你用什么序列做的?
就是测序之后的序列(将引物之前之后的序列去除)和与NCBI上比对之后相似度高的序列
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3楼
2013-03-27 23:10:29
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taoqi1986918
铜虫
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虫号: 2366225
注册: 2013-03-21
性别: GG
专业: 微生物学
感谢参与,应助指数 +1
wizardfan: 应助指数-1, 请仔细说明
2013-03-28 07:37:00
可能是序列方向不一致!
[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
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耐得住寂寞才能拥有繁华!
4楼
2013-03-28 04:49:27
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