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xubaobao

木虫 (小有名气)

[求助] 关于构建进化树遇到的问题,急急!

将不同属的序列一起做完进化树之后,不同属的序列竟然去了同一枝,与已知序列不在同一枝,请问这是怎么回事?做了好几次一直都是这样,毕业,急啊!谢谢虫子们了。
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wpwupingwp

木虫 (正式写手)

你用什么序列做的?
南无观世音菩萨
2楼2013-03-27 23:07:26
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xubaobao

木虫 (小有名气)

引用回帖:
2楼: Originally posted by wpwupingwp at 2013-03-27 23:07:26
你用什么序列做的?

就是测序之后的序列(将引物之前之后的序列去除)和与NCBI上比对之后相似度高的序列
3楼2013-03-27 23:10:29
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taoqi1986918

铜虫 (小有名气)

感谢参与,应助指数 +1
wizardfan: 应助指数-1, 请仔细说明 2013-03-28 07:37:00
可能是序列方向不一致!

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
耐得住寂寞才能拥有繁华!
4楼2013-03-28 04:49:27
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galois2

金虫 (小有名气)

★ ★
感谢参与,应助指数 +1
wizardfan: 金币+2, 应助指数-1, 谢谢参与,不过回帖更倾向于交流,而不是应助 2013-03-28 07:36:29
这个具体问题需要具体分析,可以把你的序列发到我的邮箱,我帮你看看
dylan.galois.wang@gmail.com
5楼2013-03-28 06:55:27
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qiuqu_200212

至尊木虫 (知名作家)

无助又无奈

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
xubaobao: 金币+5 2013-03-29 00:11:40
wizardfan: 应助指数-1, 答非所问 2013-03-29 08:02:18
mega、贝叶斯等。然后在网上找一个流程说明书。
无奈又无助的天鹅,孤零零
6楼2013-03-28 08:15:00
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rommel1941

铁杆木虫 (正式写手)

情定山河

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
xubaobao: 金币+5 2013-03-29 00:11:46
wizardfan: 金币+2, 谢谢分析 2013-03-29 08:02:04
估计是你所得的序列中所含信息量很少,大都是不变位点。或是你选用的model有问题。如果你选用的几种建树方法均一致的话,建议改变分析思路,或者换Marker。希望你把问题说的再明白一点。祝好
将相本无种★男儿当自强
7楼2013-03-28 17:20:56
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