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转录组数据基因注释用的参考数据选用?
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fhx20071215
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在线: 48小时
虫号: 1604460
注册: 2012-02-07
性别: GG
专业: 园艺作物采后生物学
[
求助
]
转录组数据基因注释用的参考数据选用?
课题组对某物种混合样进行了转录组测序,公司需要确定一下基因注释用的参考数据。目前该物种在GenBank登录的核酸数据量很少,我们该选用所有植物的基因数据库,还是选择这个物种比较近缘的已经发表基因组文章的物种呢?二者有什么区别?各有什么优势?
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1楼
2013-03-23 09:59:20
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wizardfan
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注册: 2012-07-05
性别: GG
专业: 生物信息学
【答案】应助回帖
感谢参与,应助指数 +1
我会选择最接近的基因组,进化差异少
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2楼
2013-03-24 09:46:53
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