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打开由AMBER创建的pdb文件出现问题
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各位大神,小弟之前看一篇文章讲AMBER模拟的。小弟比较感兴趣,就想拿个由AMBER创建出来的pdb文件来玩玩。但将那些supporting information入边提供的坐标值贴到记事本,存成pdb文件后再打开却发现打不开。用PDBViewer、Sybyl和AMBER都打不开。 小弟以为是对得不齐整,就用tab键将那些坐标值全部对齐再开,一样打不开。将当中“RC”改成“C”也无效。 一番努力依旧无果,于是向各位大神求助。急,谢! 原文:The Nuclear Magnetic Resonance of CCCC RNA Reveals a Right-Handed Helix, and Revised Parameters for AMBER Force Field Torsions Improve Structural Predictions from Molecular Dynamics, Biochemistry, 2013, 52 (6), pp 996–1010, DOI: 10.1021/bi3010347 附上此文supporting info及我复制到记事本后存的pdb文件供大家参考。 |
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- 附件 2 : rC4.pdb
2013-03-17 21:55:42, 7.31 M
2013-03-17 21:55:54, 4.74 K
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