| 查看: 3693 | 回复: 8 | |||
| 当前只显示满足指定条件的回帖，点击这里查看本话题的所有回帖 | |||
[求助]
gromacs计算时原系统带电荷，如何添加离子中和电性？ 已有1人参与
|
|||
| 如题，在做gromacs时，提示系统带3个正电荷，怎么添加离子中和电性呢？谢谢各位啦。 |
回复此楼» 收录本帖的淘帖专辑推荐
 Gromacs |
» 猜你喜欢
职称评审没过，求安慰
已经有55人回复
-
最近几年招的学生写论文不引自己组发的文章
已经有5人回复
-
26申博自荐
已经有3人回复
-
A期刊撤稿
已经有4人回复
» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:
- Gromacs中加入离子
已经有5人回复
- 【讨论】gromacs电荷不为整数
已经有6人回复
9楼2016-07-22 20:57:09
【答案】应助回帖
★ ★
感谢参与，应助指数 +1
lid5251: 金币+2, ★有帮助 2013-03-05 11:12:03
感谢参与，应助指数 +1
lid5251: 金币+2, ★有帮助 2013-03-05 11:12:03
|
多看手册 genion 命令即可 例如我要添加46个离子，使用下面的命令： genion -s em.tpr -o lions.gro -g add_ions.log -pname NA+ -np 46 -p mono.top -random -seed 1993 如果你是初学者，推荐你下载一个GROMACS_MD_Flowchart.pdf http://ishare.iask.sina.com.cn/f/15271185.html 再把论坛里的入门教程顺着做一遍，你就会很熟悉了。 记得多读手册 |
2楼2013-03-05 10:10:07
3楼2013-03-05 11:12:56
4楼2013-03-05 14:10:14