24小时热门版块排行榜

返回列表

huangjin5698

木虫 (小有名气)

应助: 0 (幼儿园)
金币: 2243.7
红花: 2
帖子: 98
在线: 45.9小时
虫号: 634796
注册: 2008-10-23
性别: GG
专业: 有机合成

[求助] checkcif 时出现错误，怎么回事呀？？？

把CIF文件上传之后，再上传FCF文件，出现在如下错误：
Software error:
Can't call method "size" on an undefined value at /Local/Ix86/Linux/httpd/cgi-bin/checkcif_hkl.pl line 157.
For help, please send mail to the webmaster (support@iucr.org), giving this error message and the time and date of the error.

如果只上传CIF文件，出现如下警告：这什么ALART代表什么意思呀？
Alert level C
ABSTY02_ALERT_1_C  An _exptl_absorpt_correction_type has been given without
         a literature citation. This should be contained in the
         _exptl_absorpt_process_details field.
         Absorption correction given as psi-scan
PLAT340_ALERT_3_C Low Bond Precision on  C-C Bonds ...............    0.0041 Ang
Alert level G
PLAT005_ALERT_5_G No _iucr_refine_instructions_details  in the CIF       ?
PLAT199_ALERT_1_G Check the Reported _cell_measurement_temperature       293 K
PLAT200_ALERT_1_G Check the Reported _diffrn_ambient_temperature       293 K
0 ALERT level A = Most likely a serious problem - resolve or explain
0 ALERT level B = A potentially serious problem, consider carefully
2 ALERT level C = Check. Ensure it is not caused by an omission or oversight
3 ALERT level G = General information/check it is not something unexpected
3 ALERT type 1 CIF construction/syntax error, inconsistent or missing data
0 ALERT type 2 Indicator that the structure model may be wrong or deficient
1 ALERT type 3 Indicator that the structure quality may be low
0 ALERT type 4 Improvement, methodology, query or suggestion
1 ALERT type 5 Informative message, check

回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

cif文件checkcif时遇到的A类错误，求助各位老师同学帮忙，万分感激！已经有5人回复
checkcif后，B、C类错误如何解决？已经有4人回复
checkcif中B类和C类错误已经有8人回复
A类错误.A VERY LARGE Solvent Accessible VOID(S) in Structure 已经有9人回复
wR2值偏大，但checkcif后没有A,B类错误，只有C类错误，请问这样的数据能用吗？已经有5人回复
checkcif 时出现如下错误，如何办已经有5人回复
checkcif 的下列A类错误如何解决已经有5人回复
checkcif的错误不知道怎么解决已经有4人回复
新手求助pubcif添加图片问题以及checkcif时的C类和G类问题已经有8人回复
fluent模拟中出现错误，怎么回事？已经有3人回复
高斯计算中输入文件错误是怎么回事？已经有4人回复
重金求助解决checkcif错误，主要是晶格水的加氢已经有10人回复
check cif 中的错误已经有11人回复
Checkcif有A类和B类错误，是不是要修正啊，要不然就发不了文章？已经有3人回复
CHeckcif中的两个A错误，不知道是什么原因，如何解决，请高手指点已经有10人回复
【求助】用checkcif文件中z值不对怎么办？已经有3人回复
【求助】运行fortran程序出现错误 : error LNK2019 怎么回事啊已经有8人回复
【求助】checkcif的A类错误问题已经有3人回复
【求助】安装abinit时出现如下错误是怎么回事？已经有4人回复
【请教】在checkcif中出现a和b错误，应该如何修改？已经有5人回复
【求助】checkcif 后出现的A类错误，请高手帮忙！已经有3人回复

1楼2013-03-03 23:28:19

已阅回复此楼关注TA 给TA发消息送TA红花 TA的回帖

luxtal

至尊木虫 (职业作家)

应助: 691 (博士)
金币: 13882.5
红花: 50
帖子: 3005
在线: 701.3小时
虫号: 2014485
注册: 2012-09-19
专业: 结构化学

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与，应助指数 +1
huangjin5698: 金币+10 2013-03-04 09:02:21

Software error:
Can't call method "size" on an undefined value at /Local/Ix86/Linux/httpd/cgi-bin/checkcif_hkl.pl line 157.
For help, please send mail to the webmaster (support@iucr.org), giving this error message and the time and date of the error.

上面应该是服务器程序出错。为稳妥起见，查看一下你的CIF的157行，有没有不该出现的字符。

如果只上传CIF文件，出现如下警告：这什么ALART代表什么意思呀？

Alart是警告，提示你去处理精修中的不足之处，一般A和B类要干预，C-G类大都可以忽略。

Alert level C
ABSTY02_ALERT_1_C  An _exptl_absorpt_correction_type has been given without
         a literature citation. This should be contained in the
         _exptl_absorpt_process_details field.
         Absorption correction given as psi-scan
以上是提示你吸收矫正的细节不足，用了什么程序和算法。目前很少人用PSI-scan来进行吸收矫正，如果真是如此，就写上用到的程序和细节。

PLAT340_ALERT_3_C Low Bond Precision on  C-C Bonds ...............    0.0041 Ang

以上是说你的模型不够理想，C-C键的精度太低了，估计没有在低温下手数据，或者晶体质量不好。注意，很多人认为在室温下收集数据来解结构是种错误。

Alert level G
PLAT005_ALERT_5_G No _iucr_refine_instructions_details  in the CIF       ?
PLAT199_ALERT_1_G Check the Reported _cell_measurement_temperature       293 K
PLAT200_ALERT_1_G Check the Reported _diffrn_ambient_temperature       293 K

以上都可以忽略了。