24小时热门版块排行榜    

查看: 1313  |  回复: 6
当前只显示满足指定条件的回帖,点击这里查看本话题的所有回帖

huangjin5698

木虫 (小有名气)

[求助] checkcif 时出现错误,怎么回事呀???

把CIF文件上传之后,再上传FCF文件,出现在如下错误:
Software error:
Can't call method "size" on an undefined value at /Local/Ix86/Linux/httpd/cgi-bin/checkcif_hkl.pl line 157.
For help, please send mail to the webmaster (support@iucr.org), giving this error message and the time and date of the error.

如果只上传CIF文件,出现如下警告:这什么ALART代表什么意思呀?
Alert level C
ABSTY02_ALERT_1_C  An _exptl_absorpt_correction_type has been given without
            a literature citation. This should be contained in the
            _exptl_absorpt_process_details field.
            Absorption correction given as psi-scan
PLAT340_ALERT_3_C Low Bond Precision on  C-C Bonds ...............     0.0041 Ang  
Alert level G
PLAT005_ALERT_5_G No _iucr_refine_instructions_details  in the CIF          ?
PLAT199_ALERT_1_G Check the Reported _cell_measurement_temperature        293 K   
PLAT200_ALERT_1_G Check the Reported   _diffrn_ambient_temperature        293 K   
   0 ALERT level A = Most likely a serious problem - resolve or explain
   0 ALERT level B = A potentially serious problem, consider carefully
   2 ALERT level C = Check. Ensure it is not caused by an omission or oversight
   3 ALERT level G = General information/check it is not something unexpected
   3 ALERT type 1 CIF construction/syntax error, inconsistent or missing data
   0 ALERT type 2 Indicator that the structure model may be wrong or deficient
   1 ALERT type 3 Indicator that the structure quality may be low
   0 ALERT type 4 Improvement, methodology, query or suggestion
   1 ALERT type 5 Informative message, check
回复此楼

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐,对您同样有帮助:

已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

luxtal

至尊木虫 (职业作家)

看看的cif文件里157行前后没有异常的话,再去checkCIF没准就可以了。
What_we_observe_is_not_nature_itself,_but_nature_exposed_to_our_method_of_questioning----Werner_Karl_Heisenberg
4楼2013-03-04 09:09:17
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
查看全部 7 个回答

luxtal

至尊木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
huangjin5698: 金币+10 2013-03-04 09:02:21
Software error:
Can't call method "size" on an undefined value at /Local/Ix86/Linux/httpd/cgi-bin/checkcif_hkl.pl line 157.
For help, please send mail to the webmaster (support@iucr.org), giving this error message and the time and date of the error.

上面应该是服务器程序出错。为稳妥起见,查看一下你的CIF的157行,有没有不该出现的字符。

如果只上传CIF文件,出现如下警告:这什么ALART代表什么意思呀?

Alart是警告,提示你去处理精修中的不足之处,一般A和B类要干预,C-G类大都可以忽略。

Alert level C
ABSTY02_ALERT_1_C  An _exptl_absorpt_correction_type has been given without
             a literature citation. This should be contained in the
             _exptl_absorpt_process_details field.
             Absorption correction given as psi-scan
以上是提示你吸收矫正的细节不足,用了什么程序和算法。目前很少人用PSI-scan来进行吸收矫正,如果真是如此,就写上用到的程序和细节。

PLAT340_ALERT_3_C Low Bond Precision on  C-C Bonds ...............     0.0041 Ang  

以上是说你的模型不够理想,C-C键的精度太低了,估计没有在低温下手数据,或者晶体质量不好。注意,很多人认为在室温下收集数据来解结构是种错误。

Alert level G
PLAT005_ALERT_5_G No _iucr_refine_instructions_details  in the CIF          ?
PLAT199_ALERT_1_G Check the Reported _cell_measurement_temperature        293 K   
PLAT200_ALERT_1_G Check the Reported   _diffrn_ambient_temperature        293 K  

以上都可以忽略了。
What_we_observe_is_not_nature_itself,_but_nature_exposed_to_our_method_of_questioning----Werner_Karl_Heisenberg
2楼2013-03-04 01:39:54
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

huangjin5698

木虫 (小有名气)

那我该怎么改动,让检测软件能够执行完全检测呢?
3楼2013-03-04 09:07:07
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

huangjin5698

木虫 (小有名气)

这是我的CIF文件和FCF文件,请高手帮忙给改一下吧

» 本帖附件资源列表

  • 欢迎监督和反馈:小木虫仅提供交流平台,不对该内容负责。
    本内容由用户自主发布,如果其内容涉及到知识产权问题,其责任在于用户本人,如对版权有异议,请联系邮箱:xiaomuchong@tal.com
  • 附件 1 : X.fcf
  • 2013-03-04 09:08:48, 105.61 K
  • 附件 2 : X.cif
  • 2013-03-04 09:09:04, 13.31 K
5楼2013-03-04 09:10:08
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
最具人气热帖推荐 [查看全部] 作者 回/看 最后发表
[考研] 一志愿华中科技大学,080502,354分求调剂 +4 守候夕阳CF 2026-03-18 4/200 2026-03-18 22:16 by li123456789.
[考研] 330求调剂 +3 小材化本科 2026-03-18 3/150 2026-03-18 21:55 by 无懈可击111
[考研] 302求调剂 +10 呼呼呼。。。。 2026-03-17 10/500 2026-03-18 12:45 by Linda Hu
[考研] 307求调剂 +3 冷笙123 2026-03-17 3/150 2026-03-18 09:55 by macy2011
[基金申请] 被我言中:新模板不强调格式了,假专家开始管格式了 +4 beefly 2026-03-14 4/200 2026-03-17 22:04 by 黄鸟于飞Chao
[考研] 277调剂 +5 自由煎饼果子 2026-03-16 6/300 2026-03-17 19:26 by 李leezz
[考研] 材料专硕326求调剂 +6 墨煜姒莘 2026-03-15 7/350 2026-03-17 17:10 by ruiyingmiao
[考研] 材料与化工专硕调剂 +5 heming3743 2026-03-16 5/250 2026-03-17 14:03 by 勇敢太监王公公
[考研] 考研调剂 +3 淇ya_~ 2026-03-17 5/250 2026-03-17 09:25 by Winj1e
[考研] [导师推荐]西南科技大学国防/材料导师推荐 +3 尖角小荷 2026-03-16 6/300 2026-03-16 23:21 by 尖角小荷
[考研] 304求调剂 +4 ahbd 2026-03-14 4/200 2026-03-16 16:48 by 我的船我的海
[考研] 318求调剂 +3 Yanyali 2026-03-15 3/150 2026-03-16 16:41 by houyaoxu
[考研] 070303 总分349求调剂 +3 LJY9966 2026-03-15 5/250 2026-03-16 14:24 by xwxstudy
[考研] 326求调剂 +3 mlpqaz03 2026-03-15 3/150 2026-03-16 07:33 by Iveryant
[考研] 0856专硕279求调剂 +5 加油加油!? 2026-03-15 5/250 2026-03-15 11:58 by 2020015
[考研] 080500,材料学硕302分求调剂学校 +4 初识可乐 2026-03-14 5/250 2026-03-14 21:08 by peike
[考研] 330求调剂 +3 ?酱给调剂跪了 2026-03-13 3/150 2026-03-14 10:13 by JourneyLucky
[考研] 281求调剂 +9 Koxui 2026-03-12 11/550 2026-03-13 20:50 by Koxui
[考研] 0703化学求调剂 +7 绿豆芹菜汤 2026-03-12 7/350 2026-03-13 17:25 by njzyff
[考研] 289求调剂 +3 李政莹 2026-03-12 3/150 2026-03-13 11:02 by 求调剂zz
信息提示
请填处理意见