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xiaohuiyi

铁虫 (小有名气)

[交流] A类错误.A VERY LARGE Solvent Accessible VOID(S) in Structure 已有6人参与

晶系是 ,MONOCLICNIC
z=4
解完之后R=0.057 goof=1.07
checkcif的时候出现A类错误,A VERY LARGE Solvent Accessible VOID(S) in Structure
我有两个疑问,不知道各位同学和老师有遇到过没
1.Squeez之后有个信息表
voids的体积945.9立方埃,可是我的晶格常数是a 14.089(5) b 16.306(5) c 16.915(5),这个空洞是不是太大了?
2就是这cif模拟出的XRD怎么和粉末不一样?粉末就是这个晶体研磨出来的。。。

先谢谢大家了

[ Last edited by xiaohuiyi on 2012-5-28 at 17:33 ]
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cfocus20

至尊木虫 (职业作家)

★ ★
小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
linhua0402313: 金币+1, 欢迎回帖交流,辛苦了 2012-05-30 09:02:43
linhua0402313: 专家考核 2012-05-30 09:03:04
Q1: 必須將xxx.sqz檔案內容copy至xxx.cif檔案在最後面, 這樣進行cif check就不會出現上述這個問題了!
Smart_work_and_beautiful_life!
2楼2012-05-29 02:08:58
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xiaochong98

木虫 (职业作家)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
linhua0402313: , 感谢回帖交流,很专业啊,能不能详细点 2012-05-30 09:03:56
粉末与单晶模拟不一样,考察一下,是否存在压力转晶,在研磨时溶剂挥发了。
北京人
3楼2012-05-29 07:59:51
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jkyuan

至尊木虫 (著名写手)

jkyu2an


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
linhua0402313: , 乱码,请重新编辑,谢谢 2012-05-30 09:04:36
还有??些溶剂分??没有定??。建议尽??????使用squeeze命令
4楼2012-05-30 08:14:55
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尚云凤

木虫 (小有名气)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
2楼: Originally posted by cfocus20 at 2012-05-29 02:08:58
Q1: 必須將xxx.sqz檔案內容copy至xxx.cif檔案在最後面, 這樣進行cif check就不會出現上述這個問題了!

sqz中的全部内容还是只要数据那部分粘贴到cif中呢?我试了下,检查时提示加进去sqz中的都是错误。怎么回事啊?求指教!
人生没有彩排,每时每刻都是现场直播!
5楼2012-05-31 08:51:26
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cfocus20

至尊木虫 (职业作家)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
5楼: Originally posted by 尚云凤 at 2012-05-31 08:51:26
sqz中的全部内容还是只要数据那部分粘贴到cif中呢?我试了下,检查时提示加进去sqz中的都是错误。怎么回事啊?求指教!...

抱歉是將sqf 裡面內容複製到cif檔內
sqf會有如下面所示內容
# SQUEEZE RESULTS (APPEND TO CIF)
# Note: Data are Listed for all Voids in the P1 Unit Cell
# i.e. Centre of Gravity, Solvent Accessible Volume,
# Recovered number of Electrons in the Void and
# Details about the Squeezed Material
loop_
  _platon_squeeze_void_nr
  _platon_squeeze_void_average_x
  _platon_squeeze_void_average_y
  _platon_squeeze_void_average_z
  _platon_squeeze_void_volume
  _platon_squeeze_void_count_electrons
  _platon_squeeze_void_content
   1  0.000  0.000  0.000       331        50 ' '
   2  0.000  0.000  0.500       332        50 ' '
   3  0.500  0.500  0.500       332        50 ' '
   4  0.500  0.500  0.000       331        50 ' '
_platon_squeeze_details
;
;
Smart_work_and_beautiful_life!
6楼2012-05-31 15:30:32
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knight1014

至尊木虫 (著名写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
这个问题要么使用PLATON程序中的squzee,要么就要将大量无序的水分子找出来,非常麻烦,如果是MOF的话就用第一种方法吧。
7楼2012-05-31 23:06:32
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xiaohuiyi

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
6楼: Originally posted by cfocus20 at 2012-05-31 15:30:32
抱歉是將sqf 裡面內容複製到cif檔內
sqf會有如下面所示內容
# SQUEEZE RESULTS (APPEND TO CIF)
# Note: Data are Listed for all Voids in the P1 Unit Cell
# i.e. Centre of Gravity, Solvent Accessible V ...

谢谢
8楼2012-09-06 21:47:27
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xiaohuiyi

铁虫 (小有名气)

引用回帖:
7楼: Originally posted by knight1014 at 2012-05-31 23:06:32
这个问题要么使用PLATON程序中的squzee,要么就要将大量无序的水分子找出来,非常麻烦,如果是MOF的话就用第一种方法吧。

谢谢,是不是如果用squzee的话 还需要其他方法来佐证溶剂分子是水或者什么其他分子?
9楼2012-09-06 21:48:50
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xyyl

木虫 (正式写手)


小木虫: 金币+0.5, 给个红包,谢谢回帖
引用回帖:
3楼: Originally posted by xiaochong98 at 2012-05-29 07:59:51
粉末与单晶模拟不一样,考察一下,是否存在压力转晶,在研磨时溶剂挥发了。

请教一下, 压力转晶什么表征手段可以看出来?
10楼2019-03-05 11:13:27
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