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万岁子郎

木虫 (正式写手)

[求助] 求请解读审稿人提出的关于我文章中方差分析的审稿意见

各位大侠,最近投了一篇材料的文章,然后在文章中,我用one way ANOVA对我的数据进行了分析。但是审稿人说我的分析是错的,还请各位帮我看看审稿人具体是什么意思,因为我不是数学背景,所以对他提的意见,好几处不大明白!先附上审稿意见:

However, there a big issue in data analysis to prevents this manuscript to
be acceptable for publication in its present. It is a pity. I suggest the
authors follow my suggestions and redo statistical analysis, redo table and
rediscuss the data. Because your analysis is wrong, it is no useful to
review all sections. I recommend the manuscript could be acceptable after
the following issues are addressed and resubmit the paper

1. Suggestions: Redo your data analysis using a correct statistical analysis
method, provide which multi-treatment method you use, what method you use
for check data normality, which method you use to check residue and variance
assumptions, provide analysis model, indicate fixed and random effects in
your model. Provide SEM data in your table. Provide p value in your table.
Provide n= ?? in your table that you use for statistical analysis


2. In the manuscript, you said you used Fisher test to separate mean.
Fishers protected LSD method (based on T test) has very high error I. You
set error 5% but actually error is 21%. Too high. See the following Table.


Table 1. The probability of type I error using t test for multi-sample pair
comparison

K
(how many means:  )
How many treatments T test: α significant level

0.20 0.10 α =0.05 0.02 α =0.01 0.001

2 0.20 0.10 0.05 0.02 0.01 0.001
3 0.41 0.23 0.13 0.05 0.03 0.003
4 0.58 0.36 0.21 (21%) 0.09 0.05 0.006
5 0.71 0.47 0.29 (29%) 0.13 0.07 0.009
10 0.96 0.83 0.63 0.37 0.23 0.034
20 1.00 0.98 0.92 0.71 0.52 0.109

1.00 1.00 1.00 1.00 1.00 1.00


3. You said you studied “the effects of different levels of static
deformation on the orientation and content of different secondary structures
in single A. pernyi silk fibers.” When treatments are quantitative data, we
have to check linear, quadratic and cubic effect of treatment levels on
response parameters. You did not do that.

4. We discuss the results based on correct statistical analysis. You can see
that you analyses are incorrect. You should redo the analysis before you can
discuss. If treatment level has quadratic effect, you should give optimal
point using 2nd derivative function. If your treatment has cubic effect, you
should give max and min points.

其实在我的文章中,我只是用one way ANOVA 比较了不同拉伸条件下蛋白质结构的变化如下表(这是其中之一,其他基本差不多):

conformation                                                   content (%)
                            strain=0        strain=0.1         strain=0.2         strain=0.3
β-sheet                    38±3                38±2                38±4                37±3
random coil*           44±1             46±2                46±2                48±3
α-helix**               18±3                17±3                15±4                15±3
* It shows significant difference by one way ANOVA analysis (significance level at p < 0.0001).
** It shows significant difference by one way ANOVA analysis (significance level at p < 0.05).

请教各位,我应该如何回答审稿人啊?或者我需要修改?谢谢各位大侠帮助!在这里给各位拜早年了! 新年快乐!
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nono2009

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【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
万岁子郎: 金币+5 2013-02-09 16:16:23
审稿人极其认真、专业、而且nice的,按其要求去做,被录用的可能性应该很高的。
4楼2013-02-09 10:16:41
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万岁子郎

木虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by yaofengluan at 2013-02-09 09:56:55
你自己搜索下correct statistical analysis吧,这个分析的前提你要先验证一下,就是第一个审稿人提的正态性,残差以及方差一致性,指明固定效应和随机效应等,样本数以及a等。T test 犯第一类错误的概率大(即弃真) ...

非常感谢!祝福新年快乐!!!
5楼2013-02-09 16:13:09
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普通回帖

onesupeng

金虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
万岁子郎: 金币+5, 有帮助 2013-02-09 16:13:34
万岁子郎: 金币+5, 有帮助 2013-02-09 16:13:51
万岁子郎: 金币+5, 有帮助 2013-02-09 16:15:59
如果你觉得杂志很不错,继续认真修改。如果你觉得是鸡勒,就换个杂志。说实话这样做和重写一篇文章差不多
长期招收博士生,参见http://fsl-unsw.com
2楼2013-02-09 09:10:35
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yaofengluan

至尊木虫 (知名作家)

你自己搜索下correct statistical analysis吧,这个分析的前提你要先验证一下,就是第一个审稿人提的正态性,残差以及方差一致性,指明固定效应和随机效应等,样本数以及a等。T test 犯第一类错误的概率大(即弃真),要换一种多重比较的方法。我也不是很清楚,这些供你参考。
我个人认为既然两个审稿人都提到了,你就要认真对待,与杂志水平无关。这个应该还是比较容易解决的,请不要灰心。
3楼2013-02-09 09:56:55
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万岁子郎

木虫 (正式写手)

引用回帖:
3楼: Originally posted by yaofengluan at 2013-02-09 09:56:55
你自己搜索下correct statistical analysis吧,这个分析的前提你要先验证一下,就是第一个审稿人提的正态性,残差以及方差一致性,指明固定效应和随机效应等,样本数以及a等。T test 犯第一类错误的概率大(即弃真) ...

你没用应助回帖,我都没法给你红包啊!呵呵,非常感谢你的意见。请教一下correct statistical analysis 是一种分析方法吗?
6楼2013-02-09 16:17:45
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mathstu

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
万岁子郎: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-02-11 06:45:20
统计分析包括统计描述和统计推断,你做方差分析相当于统计推断,少了统计描述,统计描述即为数据的分布是怎样的是否满足正态分布,方差是否齐,集中趋势和离散趋势用什么统计量?在满足方差分析前提条件的情况下,方差分析要报告统计量F值和P值,有统计学差异还需根据你的数据做两两比较。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
7楼2013-02-10 13:50:41
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万岁子郎

木虫 (正式写手)

引用回帖:
7楼: Originally posted by mathstu at 2013-02-10 13:50:41
统计分析包括统计描述和统计推断,你做方差分析相当于统计推断,少了统计描述,统计描述即为数据的分布是怎样的是否满足正态分布,方差是否齐,集中趋势和离散趋势用什么统计量?在满足方差分析前提条件的情况下,方 ...

你好,我不知道集中趋势和离散趋势用什么统计量?是什么意思,你能具体解释一下吗?非常感谢!
8楼2013-02-11 06:46:20
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yaofengluan

至尊木虫 (知名作家)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
感谢参与,应助指数 +1
万岁子郎: 金币+5, ★★★很有帮助, 非常感谢!!! 2013-02-12 04:37:05
引用回帖:
6楼: Originally posted by 万岁子郎 at 2013-02-09 16:17:45
你没用应助回帖,我都没法给你红包啊!呵呵,非常感谢你的意见。请教一下correct statistical analysis 是一种分析方法吗?...

我想应该是你分析的数据有相关性,所以不能简单的用单因素方差分析,我只是给你一些方向,谈不上真正帮忙
9楼2013-02-11 21:29:26
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mathstu

金虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

★ ★ ★ ★ ★
万岁子郎: 金币+5, ★★★很有帮助 2013-02-12 16:05:58
引用回帖:
8楼: Originally posted by 万岁子郎 at 2013-02-11 06:46:20
你好,我不知道集中趋势和离散趋势用什么统计量?是什么意思,你能具体解释一下吗?非常感谢!...

就是说你数据在分析前先看它满足什么样的分布,先做正态性检验如果满足正态性就用均数描述集中趋势,用标准差描述离散趋势,不满意正态性就用中位数描述集中趋势,用四分位数间距描述离散趋势,这些统计量用SPSS很快就出来了,文章中一般先报告统计描述再统计推断。上面的两组统计量只需用一组即均数和标准差或者中位数和四分位数间距。这两个到底用哪个取决于你数据是否服从正态分布。你既然做了方差分析肯定满足正态性,所以统计描述用均数和标准差。

[ 发自手机版 http://muchong.com/3g ]
10楼2013-02-12 14:12:22
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