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小木虫论坛-学术科研互动平台 » 计算模拟区 » 计算模拟 » 求助参数拟合~~~着急
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歪猴

至尊木虫 (初入文坛)

[求助] 求助参数拟合~~~着急

现有一生物反应过程，反应底物为A和C，反应过程为：A->B, aB+bC>D
各物质降解速率如下，
dCA/dt=-k1*CA/(Km1+CA+CB/K1);
dCB/dt=k1*CA/(Km1+CA+CB/K1)-a*k2*CB/(Km2+CB)*CC/(Km3+CC);
dCC/dt=-b*k2*CB/(Km2+CB)*Co2/(Km3+CC)
实验设计了7组，底物浓度分别为（An,Cn),n=1~7.检测的数据分别为A和B随时间的变化，如何拟合k1,k2,Km1,Km2,Km3,K1,a,b这几个参数。
本人之前一直研究生物过程，没有涉及到动力学及数值模拟，想请大家帮忙看看，谢谢！！！！！
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1楼 2012-12-31 14:39:16
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dingd

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

★
感谢参与，应助指数 +1
csgt0: 金币+1, 谢谢指导 2013-01-04 08:56:45
1：把能给出的数据都给出来；
2：别涉及你的专业，给出通俗的微分方程、对应数据，需求参数；
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2楼2012-12-31 19:25:26
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dingd

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

公式中有个“Co2”是什么？参数？
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7楼2013-01-02 12:49:51
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dingd

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

“Co2”改为“CC”后，第一个数据CC的初值为0有问题吧？会导致后面计算的CC均为0.
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10楼2013-01-02 13:17:34
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dingd

铁杆木虫 (职业作家)
求解代码及一组结果如下：
CODE:
InitialODEValue t=[0,0,0,0,0,0,0], A=[616.84501,712.63566,679.28027,687.81967,678.90824,635.09224,650.14518],
                B=[0,0,0,0,0,0,0], C=[0,37.5,75,150,225,300,375];
Variable t,A,B;
ODEFunction A'=-k1*A/(Km1+A)*(1-B/bb)^n;
            B'=1/3*k1*A/(Km1+A)*(1-B/bb)^n-a1*k2*B/(Km2+B)*C/(Km3+C);
            C'=-b1*k2*B/(Km2+B)*C/(Km3+C);
Data;
1        436.05859        62.992
2        195.38594        139.068
3        59.61301        185.744
4        29.11185        194.756
5        20.2847        195.864
6        21.18863        200.804
7        17.33457        204.756
Data;
1        395.99783        90.896
2        122.58308        160.056
3        29.0014        177.96
4        13.6578        184.756
5        18.1949        182.9
6        19.29648        183.888
7        17.20668        185.744
Data;
1        305.75867        96.824
2        71.87568        169.936
3        8.67891        181.792
4        17.84903        185.744
5        19.45634        170.924
6        17.86065        169.936
7        19.40693        175.864
Data;
1        302.02087        91.884
2        77.48239        157.092
3        9.67876        175.864
4        17.44211        170.924
5        19.91557        161.284
6        9.83571        163.02
7        12.29464        169.936
Data;
1        248.90686        97.812
2        71.41645        138.32
3        7.53083        143.26
4        17.45664        158.08
5        10.16706        149.188
6        12.29173        145.236
7        10.22228        143.26
Data;
1        325.11328        63.232
2        104.39108        112.632
3        9.21371        126.464
4        19.36333        116.584
5        19.3924        106.704
6        11.31804        103.74
7        10.3647        98.8
Data;
1        323.09033        40.508
2        95.70345        79.04
3        19.13662        79.04
4        20.11322        64.22
5        18.71808        31.616
6        18.92735        34.58
7        19.60167        15.808

均方差(RMSE): 27.9385039360891
残差平方和(SSE): 76494.8802143127
相关系数(R): 0.980173945595552
相关系数之平方(R^2): 0.960740963624351
决定系数(DC): 0.960392346059087

参数                  最佳估算
--------------------        -------------
k1        530.728692963679
km1        206.234215455803
bb        213.633640098965
n        0.268973525948127
a1        77.8320342628069
k2        164.28450201104
km2        4.98244328911804E-5
km3        62404.2816128783
b1        163.787362906208
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15楼2013-01-04 09:14:06
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dingd

铁杆木虫 (职业作家)

【答案】应助回帖

运行代码都已给出了，自己慢慢试吧，这样的计算比较费时间。
如果知道参数的合理范围建议自己运行时把范围约束加上。
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17楼2013-01-05 08:48:02
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