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北京石油化工学院2026年研究生招生接收调剂公告
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rustboy

铜虫 (初入文坛)

[求助] vasp 计算单分子/原子 时晶胞大小的选取

我觉得,原则上讲应该是使相邻晶胞内分子/原子距离足够大,以消除计算过程中互相的影响。满足这一条件后,在相同的精度下,所得到的单分子/原子的能量大致应该是相当的。

但是本人在计算单个金属Ni时发现,使用10*10*10的晶胞以及15*15*15晶胞,其它参数一样。计算所得单原子的能量相差较大。

不知道大家平时计算类似的体系时,是如何设置晶胞大小的?
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emilyoyang

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
sunyang1988: 金币+1, 谢谢交流 2013-01-03 12:09:43
这个能量差别很多  可能是你的cutoff 取得过小。。。不知道你取多少

你试着计算一下9.5*10*10.5 和14.5*15*15.5这两个超胞 中单个Ni原子的能量差 是不是也很大? 也有可能是对称性造成的
2楼2012-12-30 20:19:41
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hn19870519

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


感谢参与,应助指数 +1
sunyang1988: 金币+1, 谢谢提示 2013-01-03 12:09:52
你说的能量相差很大是多大?最好把你计算的参数贴出来,这样大家也好帮你。
3楼2012-12-31 22:17:09
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rustboy

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
3楼: Originally posted by hn19870519 at 2012-12-31 22:17:09
你说的能量相差很大是多大?最好把你计算的参数贴出来,这样大家也好帮你。

如下是我的INCAR参数:
  NWRITE =      2;   LPETIM=F    write-flag & timer
   ISTART =      0   job   : 0-new  1-cont  2-samecut
   ICHARG =      2    charge: 1-file 2-atom 10-const  
   INIWAV =      1    electr: 0-lowe 1-rand  2-diag

Electronic Relaxation 1
   PREC = Accurate ! standard precision
   ENCUT =       400.000
   NELM   =      500;   NELMIN= 2; NELMDL= 0     # of ELM steps
   ISPIN  =      2    spin polarized calculation?
   EDIFF  =      0.1E-04  

Ionic Relaxation
   EDIFFG =    -0.03  
   NSW    =      500  number of steps for IOM
   NBLOCK =      1;   
   IBRION =      2   
   ISIF   =      2   
   ISYM   =      2    0-nonsym 1-usesym
   LCORR  =      T    Harris-correction to forces
   POTIM  =     0.5    time-step for ion-motion

Electronic Relaxation 2
   LPLANE =   .TRUE.
   ALGO   =   Fast
   LDIAG  =   T     sub-space diagonalisation
   LWAVE   =  F     write WAVECAR
   LCHARG  = F      write CHGCAR and CHG
   LVDW =   .TRUE.
   LREAL  =   Auto     real-space projection
   NSIM = 4
昨天又算了一个Co原子,情况也是类似,10*10*10的能量是1.480eV,15的是1.93,20的是1.476。
谢前辈帮忙!
4楼2013-01-01 09:51:57
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rustboy

铜虫 (初入文坛)

引用回帖:
2楼: Originally posted by emilyoyang at 2012-12-30 20:19:41
这个能量差别很多  可能是你的cutoff 取得过小。。。不知道你取多少

你试着计算一下9.5*10*10.5 和14.5*15*15.5这两个超胞 中单个Ni原子的能量差 是不是也很大? 也有可能是对称性造成的

cutoff我取的是400,具体INCAR参数请见三楼
我新算了一个Co原子。
结果是10*10*10的超胞能量1.480eV,9.5*10*10.5的1.785eV,15*15*15的1.931, 14.5*15*15.5的1.944。貌似没有规律性。
这些能量差距,请问前辈是何原因?

另外,本人菜鸟,前辈提到的 “对称性造成的” 是什么意思?
5楼2013-01-01 10:51:27
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hn19870519

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖


sunyang1988: 金币+1, 谢谢交流 2013-01-03 12:10:18
我自己算了一下,结果如下:
15*15*15 -1.840572eV   
10*10*10 -1.844656eV


INCAR:
general:
   SYSTEM = general
   ENCUT  = 400
   ISTART = 0 ; ICHARG = 2
   ISMEAR = 0 ; SIGMA = 0.05
   IALGO = 38
   NELM = 200
  #PREC = Accurate
   EDIFF = 1E-5
   ISPIN=2
   MAGMOM=3.0

Write flags
   LWAVE = .FALSE.
   LCHARG = .FALSE.

Cluster
   NPAR =  8 ; NSIM = 4
   LPLANE = .TRUE.
   LSCALU = .FALSE.
6楼2013-01-03 10:24:41
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hn19870519

木虫 (正式写手)

【答案】应助回帖

补充一下,EDIFF=1E-4的时候:
10*10*10  -1.844339
15*15*15 -1.840564
用的势是PBE。看你了一下楼主的INCAR,感觉好乱,推荐自己不懂得参数就用默认的。比如 LREAL  =   Auto     real-space projection这个参数如果原子数少于20会提示你别用。还有ALGO=Fast对于单个原子个人认为不太好,个人偏向用IALGO=38。楼主再检查一下吧。
7楼2013-01-03 10:36:48
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