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lijuanshu

铜虫 (正式写手)

[交流] 如何用VASP计算H原子的振动频率

虫友们好：
    我想计算H原子的二元合金（111）表面的振动频率，该面共取7层，下面3层固定，上面4层允许弛豫，在计算振动频率之前是不是先结构优化，把优化结果的CONTCAR拷成POSCAR，计算振动频率的时候，是只允许H原子动，固定其他原子，还是原来可以动的上面四层还是可以动的，究竟是那种情况，还请虫友们指点，不胜感激！
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1楼 2012-09-10 19:22:16
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回帖置顶 ( 共有8个 )

wzbhit

至尊木虫 (著名写手)
★ ★ ★
lijuanshu(金币+1): 谢谢参与
sunyang1988: 金币+2, 谢谢交流 2012-09-13 10:44:58
只允许H原子动，其他所有原子固定
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2楼2012-09-10 23:45:25
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lijuanshu

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
2楼: Originally posted by wzbhit at 2012-09-10 23:45:25
只允许H原子动，其他所有原子固定

谢谢，我还有一些问题：
1.我在结构优化时，PREC=High，EDIFF=1E-6，那么在计算振动频率时，还可以保持原来的设置吗？还是要提高精度？
2.结构优化时考虑自旋，在计算频率时要考虑吗？
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3楼2012-09-11 07:33:49
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wzbhit

至尊木虫 (著名写手)
引用回帖:
3楼: Originally posted by lijuanshu at 2012-09-11 07:33:49
谢谢，我还有一些问题：
1.我在结构优化时，PREC=High，EDIFF=1E-6，那么在计算振动频率时，还可以保持原来的设置吗？还是要提高精度？
2.结构优化时考虑自旋，在计算频率时要考虑吗？...

1. 这个精度可以了  不需要提高
2. 考虑
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lijuanshu
4楼2012-09-11 08:09:52
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lijuanshu

铜虫 (正式写手)
送鲜花一朵
引用回帖:
4楼: Originally posted by wzbhit at 2012-09-11 08:09:52
1. 这个精度可以了  不需要提高
2. 考虑...

我想请问下，在计算振动频率的时候只要H原子动，而保持其他原子固定，只是为了减少计算量吗，这样计算出来的结构与保持原来的上面4层原子也动的结果差别大吗？
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5楼2012-09-11 08:48:06
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wzbhit

至尊木虫 (著名写手)
引用回帖:
5楼: Originally posted by lijuanshu at 2012-09-11 08:48:06
我想请问下，在计算振动频率的时候只要H原子动，而保持其他原子固定，只是为了减少计算量吗，这样计算出来的结构与保持原来的上面4层原子也动的结果差别大吗？...

我的理解是为了减少计算量，文献上都是只移动H，固定其他的
至于你说的后一种情况，我也不太清楚，我没有测试过，你可以试试
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6楼2012-09-11 09:38:48
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匿名

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lijuanshu(金币+1): 谢谢参与
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7楼2012-09-11 15:17:47
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lijuanshu

铜虫 (正式写手)
引用回帖:
7楼: Originally posted by BlueAurora at 2012-09-11 15:17:47
有区别，会多一大堆奇怪的虚频...

是只让H原子动有一大堆虚频吗？计算出的数据怎样取舍呢？
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8楼2012-09-11 15:51:37
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匿名

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lijuanshu
9楼2012-09-11 16:50:35
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lijuanshu

铜虫 (正式写手)
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引用回帖:
9楼: Originally posted by BlueAurora at 2012-09-11 16:50:35
嗯，其实我也在琢磨这件事情...

只允许H原子动，结果有两个虚频，这说明什么问题？应该怎样分析这样的结果？有没有什么可以参考的书籍或资料，还请指教。
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BlueAurora
10楼2012-09-12 10:13:11
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匿名

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lijuanshu 在你周围
11楼2012-09-12 10:46:06
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lijuanshu

铜虫 (正式写手)
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引用回帖:
11楼: Originally posted by BlueAurora at 2012-09-12 10:46:06
只有一个氢原子，只有三个平动自由度，你的两个虚频只能是平动的，这个不用考虑。剩下一个频率觉得是z方向上的振动。

嗯，我现在也在学习啦，讨论。。。讨论。。。不要用“指教”，我非常担心说错了....,啦啦啦 ...

文献中说出现虚频的位置is not a stable minimun but a secend-order saddle point on the potential energy suface，是不是有虚频出现的位置其实都不是稳定的位置，只是鞍点，而不是能量最低点
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12楼2012-09-13 09:41:35
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匿名

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13楼2012-09-13 12:09:24
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gcworm

木虫 (职业作家)
★
lijuanshu(金币+1): 谢谢参与
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14楼2012-09-13 23:33:30
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rdw00

木虫 (著名写手)
★
lijuanshu(金币+1): 谢谢参与
初学者，求指教关于原子震动频率的计算，谢谢！！
另外，带电荷能计算么？
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15楼2015-11-23 20:35:50
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承宇

木虫 (正式写手)
★
lijuanshu(金币+1): 谢谢参与
引用回帖:
13楼: Originally posted by BlueAurora at 2012-09-13 12:09:24
鞍点，就是能量的二阶导数，中只在一个方向上是负值，其他方向上都是正值。 你的说法也对.....

您好，我之前没算过零点能，我想问一下，

INCAR中别的参数设置还有什么要求吗？
也是vasp四个输入文件进行计算吗？
KPOINTS有什么要求吗，我看到有人讲用伽马点，是吗？
别的文件还有什么要求吗？

期待您的回复，谢谢您！
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16楼2016-11-03 20:31:04
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在你周围

新虫 (正式写手)
送红花一朵
引用回帖:
11楼: Originally posted by BlueAurora at 2012-09-12 10:46:06
只有一个氢原子，只有三个平动自由度，你的两个虚频只能是平动的，这个不用考虑。剩下一个频率觉得是z方向上的振动。

嗯，我现在也在学习啦，讨论。。。讨论。。。不要用“指教”，我非常担心说错了....,啦啦啦 ...

振动频率计算时分很多种吗？一个分子的？就是一个分子吸附在表面上，计算在表面的振动频率

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17楼2017-11-16 16:47:51
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