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zhalaga

新虫 (初入文坛)

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在线: 13.2小时
虫号: 667939

[交流] 使用Arlequin软件的问题

请教一个使用Arlequin软件的问题，如果想通过STR的等位基因频率计算不同人群间的差异度“population differentiation” 可以用下面的example吗？
[Profile]

      Title="Y chromosome microsatellite data scored as allele frequencies"

      #Reference:
      #       Skorecki et al. (1997) Y chromosome of Jewish priests. Nature 385:32.

      NbSamples=5
      DataType=FREQUENCY
      GenotypicData=1
      LocusSeparator=' '
      MissingData="?"
      Frequency= REL

[Data]

#Commented microsatellite haplotype definition. Not necessary here

#       [[HaplotypeDefinition]]
#
#             HaplListName="Yap-DYS19 haplotypes on Y chromosome"
#                HaplList={
#                      1 Yap- A
#                      2 Yap- B
#                      3 Yap- C
#                      4 Yap- D
#                      5 Yap- E
#                      6 Yap+ All
#             }

[[Samples]]

      SampleName="changsha"
      SampleSize=184
      SampleData= {
            1       0.001
            2       0.112
            3       0.27
            4    0.055
            5    0.483
            6    0.036
            7    0.041
            8    0.002
      }

      SampleName="shanghai"
      SampleSize=189
      SampleData= {
            1       0
            2       0.0993
            3       0.2165
            4    0.0511
            5    0.5215
            6    0.0326
            7    0.028
            8    0.0011
      }

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