应《网络安全法》要求，自2017年10月1日起，未进行实名认证将不得使用互联网跟帖服务。为保障您的帐号能够正常使用，请尽快对帐号进行手机号验证，感谢您的理解与支持！

24小时热门版块排行榜    

小木虫论坛-学术科研互动平台 » 生物医药区 » 生物科学 » 使用Arlequin软件的问题
101/1返回列表
查看: 1691  |  回复: 9
只看楼主 @他人 存档 新回复提醒 (忽略) 收藏    在APP中查看

zhalaga

新虫 (初入文坛)

[交流] 使用Arlequin软件的问题

请教一个使用Arlequin软件的问题，如果想通过STR的等位基因频率计算不同人群间的差异度“population differentiation” 可以用下面的example吗？
[Profile]

        Title="Y chromosome microsatellite data scored as allele frequencies"

        #Reference:
        #        Skorecki et al. (1997) Y chromosome of Jewish priests. Nature 385:32.
        
        NbSamples=5                 
        DataType=FREQUENCY                 
        GenotypicData=1
        LocusSeparator=' '            
        MissingData="?"        
        Frequency= REL

[Data]

#Commented microsatellite haplotype definition. Not necessary here

#        [[HaplotypeDefinition]]
#
#                HaplListName="Yap-DYS19 haplotypes on Y chromosome"
#                  HaplList={
#                        1 Yap- A
#                        2 Yap- B
#                        3 Yap- C
#                        4 Yap- D
#                        5 Yap- E
#                        6 Yap+ All               
#                }


[[Samples]]

        SampleName="changsha"
        SampleSize=184
        SampleData= {
                1        0.001
                2        0.112
                3        0.27
                4       0.055
                5       0.483
                6       0.036
                7       0.041
                8       0.002
        }

        SampleName="shanghai"
        SampleSize=189
        SampleData= {
                1        0
                2        0.0993
                3        0.2165
                4       0.0511
                5       0.5215
                6       0.0326
                7       0.028
                8       0.0011
        }
回复此楼

» 收录本帖的淘帖专辑推荐

Arlequin

» 猜你喜欢

» 本主题相关价值贴推荐，对您同样有帮助:

» 抢金币啦！回帖就可以得到:

查看全部散金贴
1楼 2012-12-30 13:44:38
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

userhung

禁虫 (文学泰斗)
★ ★ ★
zhalaga(金币+1): 谢谢参与
看天: 金币+2 2012-12-30 22:15:52
http://www.cqvip.com/QK/96140X/200406/12078881.html
http://cpfd.cnki.com.cn/Article/CPFDTOTAL-ZGFW200400001004.htm
http://www.cnki.com.cn/Article/CJFDTotal-FUAN200406004.htm
赞一下 回复此楼
2楼2012-12-30 13:50:21
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

zhalaga

新虫 (初入文坛)
没有丝毫帮助。。。。。
回复此楼
7楼2012-12-30 21:52:09
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖

凤城之女

新虫 (初入文坛)
★
zhalaga(金币+1): 谢谢参与
同问楼主这样行不行啊？。。我看example里就它比较像~~
赞一下 回复此楼
10楼2013-10-26 09:21:29
已阅   回复此楼   关注TA 给TA发消息 送TA红花 TA的回帖
简单回复
小衣冰滢3楼
2012-12-30 14:07   回复  
zhalaga(金币+1): 谢谢参与
ljqpyk4楼
2012-12-30 14:14   回复  
zhalaga(金币+1): 谢谢参与
prry20085楼
2012-12-30 14:16   回复  
zhalaga(金币+1): 谢谢参与
su-b086楼
2012-12-30 15:00   回复  
zhalaga(金币+1): 谢谢参与
neu2348楼
2012-12-31 10:01   回复  
zhalaga(金币+1): 谢谢参与
piaoyingaza9楼
2013-01-02 14:59   回复  
zhalaga(金币+1): 谢谢参与
相关版块跳转 我要订阅楼主 zhalaga 的主题更新
101/1返回列表
普通表情 龙 兔 虎 猫 高级回复 (可上传附件)
信息提示
关闭
请填处理意见
关闭